卟啉与dna相互作用课件

《卟啉与dna相互作用课件》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在教育资源-天天文库。

1、主讲人：赵婷婷卟啉与DNA的相互作用卟啉简介卟啉与DNA相互作用外文文献阅读一.卟啉简介卟啉是自然界中的一类天然大环化合物，由四个吡咯环通过次甲基相连形成的共轭骨架大环化合物，其中心的氮原子与金属原子配位即成为金属卟啉配合物。1.定义2.分类按物理性质：水溶性卟啉：带有正电荷的meso-四(4-N-甲基吡啶基)卟啉（TMPyP）带有负电荷的meso-四(4-磺酸基苯基)卟啉（TPPS）非水溶性卟啉：按取代基（与DNA相互作用的）电荷型：阳离子和阴离子卟啉化合物两亲型：卟吩环本身疏水，取代基为非离子型亲水疏水型：本身疏水，需环糊精，表面活性剂载体增加水溶性二.与DNA相互作用共价作用：各

2、种碱基的亲核反应和亲电反应，表现为DNA的烷基化及DNA的链间交联和链内交联等非共价作用：外部结合：静电结合沟槽结合嵌插结合外部堆积与DNA的非共价作用1.外部堆积电荷结合：卟啉化合物阳离子与DNA相互作用结合于带负电荷的DNA双螺旋外部。一般认为，静电结合作用于磷酸骨架，没有选择性。沟槽结合：卟啉平面以相对于DNA双螺旋链垂直的方式与DNA结合，非平面卟啉主要的作用方式2.嵌插结合即平面的或几乎平面的卟啉嵌入DNA碱基对之间，其表面紧挨着DNA碱基的芳香杂环，作用力来自芳环的离域π体系与碱基的π体系间的π-π相互作用3.外部堆积卟啉沿DNA双螺旋链相互聚集在DNA上，是在DNA表面堆

3、积的表面结合，发生在溶液离子强度较高时，DNA为卟啉聚集提供模板。卟啉与DNA作用的三种方式三.外文文献查阅1.porphyrinsforG-quadruplexDNAtargetingG-四聚体核苷酸作为小分子的治疗靶出现，被称为小分子G-四聚体配体，在核苷酸中由几串G组成，与细胞过程有关，G-四聚体常在端粒酶的、致癌基因的核酶高敏感启动区域和RNA中出现。药物靶向ingenepromotersorinthe5’-UTRregionsofmRNA，产物的生成受影响，指导的生物过程受到阻碍small-moleculeG-quadruplexligands,被称为G4-ligands,可

4、作为potentialanticanceragents可与DNA结合：阳离子卟啉,meso-tetrakis(4-N-methylpyridiniumyl)porphyrin(H2-TMPyP4)相互作用：卟啉的外部四重线的π-π堆积结合到G-四聚体核苷酸。影响：端粒系统紊乱存在的问题及解决方法无选择性：卟啉对G-四聚体的选择性吸引力小：卟啉对dsDNA和G-四聚体的吸引力非常小解决方法：在卟啉中心引入金属离子结果：调整了亲和力，在选择性上有提高，但配体的特异性不强quadruplexselectiveporphyrins在卟啉的meso-位上修饰大的阳离子取代基porphyrinH2

5、-1,Mn-1有独特的选择性影响卟啉的中心金属离子修饰：并非决定因素，其中心的轴性水分子的存在减少了配体的稳定性，但增强了G-四聚体的选择性meso-位上的大取代基修饰：H2-1andMn-1尽管存在大的阳离子取代基，仍能渗透到细胞中，产生细胞效应2.ThestabilityofDNA–porphyrincomplexesinthepresenceofMn(II)ions研究方法调查了水溶性的[CuTButPyP4]和[CoButPyP4]在Mn2+存在条件下的结合特性和动力学参数。改变动力学参数得到Mn2+存在条件下DNA-卟啉复合物的melting-curves。评估了螺旋环转化焓

6、证明离子与DNA结合分为两个阶段：第一个阶段(0.001＜[Mn]/[P]＜1)第二阶段(1＜[Mn]/[P]＜4）两个阶段的特点：第一阶段：Mn2+和DNA磷酸盐反应成为[CuTButPyP4]或[CoButPyP4]插入的最佳条Tm有很大的增长，但ΔT变化很小第二阶段：离子与DNA的磷酸盐和碱基相互作用双螺旋开始不稳定，氮碱基中的氢键部分断裂在卟啉存在时DNA的各个不稳定性也相应发生3.SynthesesandDNAbindingofnewcationicporphyrin–tetrapeptideconjugates1).意义合成cationicporphyrin–peptide

7、conjugates来增强卟啉的细胞吸收或传送肽部分到核酸附近2).合成的四肽：Ac-Lys(H-Ala-D-Ala-Ala)-NH23).用四肽连接下列两个种卟啉派生物：thetri-cationicmeso-tri(4-N-methylpyridyl)-mono-(4-carboxyphenyl)porphyrinbi-cationicmeso-5,10-bis(4-N-methylpyridyl)-15,20-di-(4-carboxyp