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时间:2018-10-18
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1、走进miRNA的大世界第一回MicroRNA的自白“什么叫做浓缩的才是精华?我的一生都是在诉说着这个哲理。虽然我是五短身材,却能‘四两拨千斤’,我在生命中扮演的角色可不容小视。要想知道我究竟有多牛,你们还得好好研究研究呢!”,microRNA得意地说……microRNA是谁?MicroRNA也可以写做miRNA,是一种21-25nt长的单链小分子RNA。它广泛存在于真核生物中,是一组不编码蛋白质的短序列RNA,其本身不具有开放阅读框(ORF)。成熟的miRNA,5′端有一个磷酸基团,3′端为羟基。编码m
2、iRNAs的基因最初产生一个长的pri-RNA分子,这种初期分子还必须被剪切成约70-90个碱基大小、具发夹结构单链RNA前体(pre-miRNA)并经过Dicer酶加工后生成。成熟的miRNA5’端的磷酸基团和3′端羟基则是它与相同长度的功能RNA降解片段的区分标志。miRNA5'端第一个碱基对U(尿苷)有强烈的倾向性,而对G却排斥,但第二到第四个碱基缺乏U。一般来讲,除第四个碱基外,其他位置碱基通常都缺乏C。这些分子能够与那些和它的序列互补的mRNA分子相结合,有时候甚至可以与特定的DNA片断结合。
3、这种结合的结果就是导致基因的沉默。这种方式是身体调节基因表达的一个重要策略。据推测,miRNA调节着人类三分之一的基因。miRNA研究的开端miRNA的研究起始于时序调控小RNA(stRNAs)。1993年,Lee等在秀丽新小杆线虫(Caenorhabditiselegan)中发现了第一个定时调控胚胎后期发育的基因lin-4,2002年,Reinhart等又在线虫C.elegan中发现第二个异时性开关基因let-7,2001年10月《science》报道了三个实验室从线虫、果蝇和人体克隆的几十个类似C.
4、elegan的lin-4的小RNA基因,称为microRNA。随后多个研究小组在包括人类、果蝇、植物等多种生物物种中鉴别出数百个miRNAs,并且发现它与多种重要的生命过程有关。MiRNA的作用方式miRNA基因是一类高度保守的基因家族,按其作用模式不同可分为三种:第一种以线虫lin-4为代表,作用时与靶标基因不完全互补结合,进而抑制翻译而不影响mRNA的稳定性(不改变mRNA丰度),这种miRNA是目前发现最多的种类;第二种以拟南芥miR-171为代表,作用时与靶标基因完全互补结合,作用方式和功能与s
5、iRNA非常类似,最后切割靶mRNA;第三种以let-7为代表,它具有以上两种作用模式:当与靶标基因完全互补结合时,直接靶向切割mRNA,如果蝇和Hela细胞中let-7直接介导RISC分裂切割靶mRNA;当与靶标基因不完全互补结合时,起调节基因表达的作用,如线虫中的let-7与靶mRNA3′端非翻译区不完全配对结合后,抑制调节基因的翻译。MiRNA的特异性研究表明MiRNAs在物种间具有高度的保守性、时序性和组织特异性——在特定的时间、组织才会表达。细胞特异性或组织特异性是miRNA表达的主要特点,又
6、如拟南芥中的miR-171仅在其花序中高水平表达,在某些组织低水平表达,在茎、叶等组织中却无任何表达的迹象;20-24h的果蝇胚胎提取物中可发现miR-12,却找不到miR3-miR6,在成年果蝇中表达的miR-1和let-7也无法在果蝇胚胎中表达,这同时体现了miRNA的又一特点——基因表达时序性。MiRNA表达的时序性和组织特异性暗示miRNA的分布可能决定组织和细胞的功能特异性,也可能参与了复杂的基因调控,对组织的发育起重要作用。第二回miRNA与近亲siRNA的差异MiRNA不爽地说,“因为si
7、RNA先被人注意到,所以它在我之前成名。”接着,miRNA意兴昂然地讲起了它的身世……“话说在“广袤”的细胞质中游荡着一个名叫Dicer的浪子。与此同时,在细胞的腹地‘细胞核’中,一个身形颀长的RNA降生了即pri-miRNA。Dicer在细胞质中遇到了一个双链的RNA并被她所吸引,于是尾随她并最终在她身上咬了一口,结果siRNA降生了。Dicer又继续游荡,这时他看到了一个非常漂亮的发夹状的RNA(她其实就是在细胞核中降生的那条RNA的化身pre-miRNA),于是非常仰慕并最终历经艰辛将她咬了一口。
8、这样我就“哇”的一声来到了这个世界上”miRNA说。“我和siRNA有许多共同点,但我们的差别也很多,所以可别把我们混在一起哦,”它补充说。siRNA是RNAi途径的主要作用物,miRNA和siRNA很容易混淆,他们有许多共同点也有许多不同点。为了能够清楚地让读者弄清两者之间的差异之处,笔者特别将它们之间的差别划分入三个大的阶段:起源阶段、成熟阶段和功能阶段(即调节基因表达的作用阶段)。在描述两者的差异之前,有必要先说一说它们的共同点:1.
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