pubmed文献查询

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1、文摘型数据库PubMed检索方法与技巧主要内容PubMed简介——是什么?PubMed特色服务——能干什么?PubMed检索方法——怎么用?其他辅助功能创建机构:美国国家医学图书馆下设的美国生物技术信息中心(NCBI)1996年1月开始向全球开放特色:免费、收录广、内容全、检索途径多、检索体系完备、文摘库,部分文献还可在网上直接免费获得全文。http://pubmed.govPubMed简介——是什么?NCBI(NationalCenterforBiotechnologyInformation,美国国立生物技术信息中心)目前国际上几个重要分子生

2、物信息网站之一成立的原因:已故的参议院议员ClaudePepper发现计算信息处理方法对生物医学研究的重要性1988年11月4日成立是NationalInstitutesofHealth(NIH美国国立卫生研究院)底下的NationalLibraryofMedicine(NLM美国国立医学图书馆)的部门之一NIH目前是全世界最大的生物医学研究单位。PubMed简介——是什么?NCBI目前提供的生物信息资源主要分为生物数据库生物信息工具PubMed简介——是什么?生物数据库永久数据的大的组织体结合计算机软件执行更新、查询与存取数据的功能。容易取得

3、信息并且只取得回答特殊生物问题的信息Entrez:NCBI的数据库搜寻与存取系统,可用来获取单一数据库或许多数据库的整合数据。目前,NCBI提供的公开(OpenAccess)数据库包括如下:PubMed简介——是什么?PubMed简介——是什么?NCBI目前提供的生物信息资源主要分为生物数据库生物信息工具PubMed简介——是什么?Entrez一个整合的访问序列,定位,分类和结构数据的搜索和检索系统。整合的数据库包括核酸序列,蛋白序列,大分子结构,全基因组,和通过PubMed检索的MEDLINE。可以检索相关的序列,结构和参考文献。BLAST序

4、列相似搜索程序,还可作为鉴别基因和遗传特点的手段。在小于15秒的时间内对整个DNA数据库执行序列搜索。附加软件工具开放阅读框寻觅器(ORFFinder),电子PCR,序列提交工具Sequin和BankIt。所有的NCBI数据库和软件工具可以从HTTP或FTP来获得。PubMed简介——是什么?Entrez可以检索的数据库:Books出版社提供之数字生医图书与医生参考书籍数据库CancerChromosomes美国国立癌症研究所的MitelmanDatabaseofChromosomeAberrationsinCancer数据库里已经整合好的cy

5、togenetic、临床与文献相关数据ConservedDomainDatabase(CDD),蛋白质功能区块保留序列数据库3DDomains,蛋白质功能区块立体结构数据Gene,包含许多物种的基因数据库Genome,包含超过800种物种的基因组数据库GENSAT,小鼠中枢神经系统基因表现图谱GEODatasets,基因表现实验与生物芯片数值结果数据GEOProfiles,基因表现图谱HomoloGene,同源基因批注数据库Journals,期刊文献(包含PubMed)MeSH,医学主题词数据库NCBIWebSite,所有NCBI网页NLMCa

6、talog,美国国立医学图书馆馆藏书目、期刊、视听数据目录Nucleotidesequencedatabase,核酸序列数据库(包含GenBank、RefSeq和PDB等三大序列数据库)PubMed简介——是什么?OnlineMendelianInheritanceinMan(OMIM),人类遗传疾病相关文献数据库PopSet,族群演化分析相关研究资料Proteinsequencedatabase,蛋白质序列数据库(包含Swiss-Prot、PIR、PRF、PDB等数据库与从GenBank、RefSeq核酸序列转译之蛋白质序列资料)PubChe

7、mBioAssay,化学成分之生物活性筛选资料PubChemCompound,小分子化学物质结构PubChemSubstance,具生物活性之化学物质筛选数据PubMed,科学文献报导数据库PubMedCentral,科学文献数字全文数据库SiteSearch,可搜寻NCBI的网页与FTPSNP,单点核酸多样性数据库(dbSNP)Structure,分子模型数据(MMDB)Taxonomy,以核酸或蛋白质为基础的分类学信息UniGene,人类unique基因序列数据库UniSTS,unique序列卷标地址数据库Entrez可以检索的数据库:Pu

8、bMed简介——是什么?http://www.medlive.cn/pubmed/pubmed_search.jsp(汉化)要注册账号英文检索新版Pu

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