malbac技术简介

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1、Malbac-MALBAC原理MALBAC(MultipleAnnealingandLoopingBasedAmplificationCycles,简称MALBAC),即多次退火环状循环扩增技术,是基于哈佛大学谢晓亮院士研究组的一项专利技术,是目前最先进的全基因组扩增技术。该技术及其在研究人类精子重组方面的独特应用2篇论文于2012年12月刊登于顶级学术期刊《Science》上。技术优势1)降低PCR扩增偏倚,使得单细胞中93%的基因组能够被测序。这种方法使得检测单细胞中较小的DNA序列变昇变得更容易,因

2、此能够发现个别细胞之间的遗传差界。这样的差异可以帮助解释癌症恶化的机制,生殖细胞形成机制,甚至是个别神经元的差异机制。2)灵敏度高:单细胞、单染色体或0.5pg的基因组DNA即可进行扩增。3)扩增均匀性显著优于其它技术。4)扩增产物用途广泛:可用于二代测序、微阵列、qPCR、基因克隆。技术简介及原理PCR扩增往往具有偏好性而且基因组具有大量的冗余,会造成基因组测序准确性不高。而谢晓亮研发的MALBAC技术能从一个细胞的基因组中,分离出来自单细胞的DNA,然后添加称作引物的短DNA分子。这些引物可与DNA的

3、随意部分互补,从而使得它们能够附着到DNA链上,充当DNA复制起点。这些引物巾两个部分构成——一个包含8个核苷酸的粘性部分变化多样,可与DNA结合,再加上一个包含27个核苷酸的共同序列。这一共同序列通过将A身掺入到新拷贝链,从而A身成环,防止了过度拷贝,从而大大地降低了扩增偏倚。利用这种方法,可以完成高达93%的基因组测序。技术应用1)样本稀少,用常规方法无法进行基因组或转录组分析癌症研究(穿刺取样、肿瘤循环细胞CTC,激光微切割组织)胚胎研究(早期胚胎发育、体外受精梢入前筛查)原始材料很少的法医学、古生

4、物学干细胞研究2)样本高度异质,细胞之间存在重要差异肿瘤遗传异质性研究,如化疗前后细胞种群及疗效分析生殖细胞,如不孕不育症研究、人类精子重组位点分析与染色体异常检测、花粉细胞遗传重组神经元的差异机制辐射前后细胞差异分析Denaturation31PrimersannealonTemplatesDenaturation51ElongationandDisplacement5l3’ExtensionandDisplacementPrimersannealonSemi-ampljcons3’Formationo

5、floopsqPCR/PCRArrayCGHMolecularcloningHigh-throughputSequencing

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