中国17个汉族人群3个STR基因座的遗传关系研究.doc

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1、中国17个汉族人群3个STR基因座的遗传关系研究作者：龙友国，邱祥智，龙思方，余跃生，戎聚全【摘要】目的探讨中国17个汉族人群3个STR基因座的遗传关系。方法收集中国17个汉族人群D16S539、D7S820和D13S317基因座的基因频率资料，计算他们间的遗传距离，构建系统发生树。结果江苏、河南、太原、江西、安徽、台湾和深圳汉族聚为一大类，泉州、广东、福建、潮汕汉族为一类，荆州、成都、湖南、西安和贵州汉族为一类，而广西汉族单独为一类。结论研究结果与遗传学和民族学研究结果一致，并提示17个汉族人群STR基因频率分布与地理距

2、离呈平行关系。【关键词】STR；遗传距离；系统发生树；群体遗传学；汉族；中国　　Abstract：ObjectiveTostudythegeneticrelationship(3shorttandemrepeatgeneloci，abbreviatedas3STRgeneloci)in17groupsofHanpopulationinChina.MethodsGeneticdataofD16S539，D7S820，andD13S317STRgenelocion17groupsofHanpopulationwerecolle

3、cted，geneticdistancewascalculatedandthePylogeneticTreechartwasconstructedbasedonthegeneticdistancesamongseventeengroupsofHanpopulation.ANeighbor-JoiningmethodwasusedtodrawthePylogeneticTree.ResultsThePylogeneticTreeshowedthatthesevengroupsofHanpopulationinJiangsu，

4、Henan，Taiyuan，Jiangxi，Anhui，TaiwanandShenzhencitiesorprovinceswereinvolvedinanidenticalcluster；Quanzhou，Guangdong，Fujian，andChaoshaninanother，andJingzhou，Chengdu，Hunan，Xi’anandGuizhouinanother，andGuangxiHanpopulationinanunattachedcluster.ConclusionThestudyresultsw

5、ereinaccordancewiththeresearchedoutcomesofgeneticandethnology.ThisindicatedthattheSTRgenefrequencydistributioninseventeengroupsofHanpopulationisparallelwiththegeographicdistance.　　Keywords：STR；geneticdistance；phylogenetictree；populationgenetics；Hanpopulation；China

6、　　微卫星DNA(microsatelliteDNA)，又称短串联重复序列(shorttandem4repeat，STR)，约占人类基因组的10%，重复单位长1～6bp，重复次数10～60次，等位基因片断长度一般在100～500bp。它因数目多、分布广，并具有高度多态性、高信息含量以及高杂合度而被广泛应用于人群遗传学、法医个体识别、人类学、民族学和考古学等领域［1］。黄辰等［2］利用D16S539、D7S820和D13S317基因座的基因频率资料对我国7个民族间的遗传关系进行了研究，但尚未见有利用这几个基因座对汉族人群遗传

7、关系研究的报道。笔者收集成都、湖南、贵州、河南、西安等地区17个汉族人群D16S539、D7S820和D13S317基因座基因频率的文献资料，以探讨他们间的遗传关系，对了解汉族的起源、进化和迁移具有较高的参考价值。　　1对象与方法　　1.1研究对象收集中国安徽、成都、湖南、福建、江苏、贵州、江西、台湾、潮汕、广西、泉州、太原、河南、西安、荆州、广东和深圳等地区17个汉族人群D16S539、D7S820和D13S317基因座的基因频率资料，各基因座的基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律。　　　　1.2研究

8、方法采用Phylip3.65和MEGA3.1统计软件包计算17个汉族人群间的Nei’s遗传距离，并通过Neighbor-joining法构建系统发生树。　　2结果　　2.1Nei’s遗传距离17个汉族人群的Nei’s遗传距离，见表1。结果显示：成都汉族和泉州汉族的遗传距离最小（0.0025），广西汉族和