癌症研究新工具ptmscan

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1、癌症研究新工具PTMScanPTMScan®技术应用案例：CST的科学家使用PTMScan®技术和一个酪氨酸磷酸化基序抗体（#9411），对酪氨酸激酶信号通路进行分析，发现了非小细胞肺癌细胞系和组织样本中的diseasedrivers。这项研究在非小细胞肺癌样本中发现了ALK（间变性淋巴瘤激酶）-EML4和ROS1（c-ros致癌基因1）融合蛋白，为诊断对ALK抑制剂crizotinib【1】有反应的病人奠定了基础。在此基础上，CST开发了创新的高敏ALK、ROS1单克隆抗体【2,3】。PTMScan®技术

2、平台介绍：PTMScan®是一项创新的蛋白质组学技术，结合高度特异性基序抗体、免疫沉淀和质谱分析，提供服务和试剂盒以支持信号调控新机制的发现，如靶点验证、生物标志物发现等。该技术可以鉴定和量化样本中大范围的翻译后修饰，包括乙酰化、甲基化、泛素化，磷酸化酪氨酸和丝氨酸/苏氨酸磷酸化。根据所使用的抗体是否对肽段序列具有靶向性，PTMScan®分为PTMScan®Discovery和PTMScan®Direct两大类：其中Discovery是在蛋白质组整体水平上对某一种翻译后修饰进行特异性亲和，所检测到的修饰肽段

3、和样品本身有很大关系，即相对含量越高的修饰肽段越容易被检测到；而在Direct实验中使用的抗体针对的是目标蛋白上特定位点的修饰，即不仅对特定的翻译后修饰有亲和力，另外修饰位点左右的氨基酸序列同样决定着这种亲和作用。1.PTMScan®发现服务(Discovery)此项服务可以鉴定并定量已知或未知蛋白的翻译后修饰，包括磷酸化、泛素化、甲基化和乙酰化修饰。利用CST专有抗体进行亲和免疫纯化，再结合串联质谱技术，可以分析细胞系和组织样本中数以千计的翻译后修饰。此项服务可对不同的生物模式系统和疾病状态蛋白质组的翻译

4、后修饰进行研究。针对不同蛋白的翻译后修饰，PTMScan®Discovery提供4种不同的服务项目：1.PhosphoScan(磷酸化)；2.AcetylScan(赖氨酸乙酰化)；3.UbiScan(赖氨酸泛素化);4.MethylScan(赖氨酸、精氨酸甲基化。其中，由于磷酸化修饰的复杂性，PhosphoScan根据各种磷酸激酶识别底物的序列特异性，提供16种不同的单克隆基序抗体(Motifantibody)和9种试剂盒供选择。PTMScan®Motif抗体及试剂盒一览KinomeView®andSeri

5、ne/ThreoninePhosphoScan®ProductslocatedintheTomb,DongShenJiabang,deferthenextdayfocusedontheassassination.Linping,Zhejiang,1ofwhichliquorwinemasters(WuzhensaidinformationisCarpenter),whogotAfewbayonets,duetomissedfatal,whennightcameDescriptionAntlbodyKitCo

6、nsenusSiteLCMSDataandOutputResultsPhospho-AktSubstrate96145561RXX(S*/T*)MouseLiverXLSRAWPhospho-AktSubstrate100015563RXRXX(S*/T*)MouseLiverXLSRAWPhospho-(Ser/Thr)AMPKSubstrate57595564(L/M)XRXX(S*/T*),RXX(S*/T*)MouseLiverXLSRAWPhospho-(Ser)ATM/ATRSubstrate9

7、60712267S*QMouseLiverXLSRAWPhospho-(Ser/Thr)ATM/ATRSubstrate669612267(S*/T*)QG,(S*/T*)QMouseLiverXLSRAWPhospho-(Ser)CDKsSubstrate9477(K/H)S*PPhospho-(Ser/Thr)CKIISubstrate873812170(S*/T*)DXEPhospho-MAPK/CDKSubstrates23254652PXS*P,S*PX(K/R)MouseLiverXLSRAWP

8、hospho-(Ser/Thr)PDK1DockingMotif9634(F/K)XX(F/Y)(S*/T*)(F/Y)MouseLiverXLSRAWPhospho-(Ser)PKCSubstrate6967(K/R)(K/R)X(S*/T*)MouseLiverXLSRAWPhospho-(Thr)PLKBindingMotif52435566ST*PMouseLiverXLSRAWPhospho-Thr-P