米心水青冈遗传多样性分析

《米心水青冈遗传多样性分析》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在行业资料-天天文库。

1、米心水青冈遗传多样性和遗传结构研究摘要：利用6对SSR引物对米心水青冈的25个居群的遗传多样性及遗传结构进行了检测分析，结果表明，米心水青冈的遗传多样性（Na=47，He=0.576）偏低，供试居群的基因分化系数Fst平均为0.1385，表明14%的遗传变异存在于居群间，而86%的遗传变异存在于居群内。居群间遗传一致度变化范围为0.0656—0.7420，且居群地理距离越远，遗传距离就越大。本研究为水青冈品种遗传多样性的评价和采用合理的保护策略提供了科学依据。关键词：水青冈；遗传多样性；遗传结构；

2、SSRGeneticdiversityandgeneticstructureofFagusenglerianaSeem.(Fagaceae)Abstract:Geneticdiversityandgeneticstructureof25populationsofFagusenglerianaSeem.werestudiedbyusing6microsatelliteloci.heresultsrevealedalowdegreeofgeneticdiversity(Numberofdifferen

3、talleles,Nawas4.7.Hewas0.576).Thegeneticdifferentiation(Fst=0.1385)suggestedthat14%geneticvariationexistedamongpopulations,meaningthat86%geneticvariationhappenedamongtheindividualswithinpopulations.theclusteranalysisshowedthatgeneticidentity(0.0656to0

4、.7420)amongpopulationswasnegativelycorrelatedwiththegeographicaldistance,consistentwiththeisdationbydistancemodelfortheisolationpopulations.Theresultsareusefulforprovidingscientificbasisfortheassessmentforgeneticdiversityandappropriateconservationstra

5、tegiesofFagusengleriana.Keywords：Fagusengleriana；Geneticdiversity；Geneticstructure；SSR近年来，SSR作为分子标记所具有的优点使其在植物遗传图谱构建及基因或QTL的定位、物种进化与分类、品种遗传多样性、品种保护与亲子鉴定、纯度鉴定、杂种优势的机理及其预测等方面得到广泛应用[1]。与RAPD技术及AFLP技术相比，微卫星技术在分析遗传多样性方面更具有优势，现已被广泛应用于农作物[2]、畜牧[3]等的分析中。分析过去的

6、历史和现在的过程（如漂变、扩散、交配和选择、居群大小，基因流），分子标记对居群遗传结构是最具价值的[4]。欧洲、日本、美国等国家已经对它们的水青冈属植物遗传多样性做了大量工作，我国虽然水青冈的种类丰富，但利用DNA分子标记对水青冈属植物遗传多样性的研究不是很多。水青冈属植物是北半球亚热带山地落叶阔叶林和常绿落叶阔叶混交林的重要建群种[5]，米心水青冈在我国北起秦岭南坡，南至贵州梵净山，西起四川二郎山，东至于浙江天目山。米心水青冈分布虽然广，但目前多呈现单株散生于山地阔叶林中，仅在四川大巴山南坡、湖

7、北西部神农架地区、安徽南部的黄山和浙江的天目山等地区有小片分布。米心水青冈分布于800-2200m的林中，其林分布上呈现自西向东，由南向北递减的特点。其分布状况在我国水青冈属植物中具有典型性，本文利用SSR分子标记分析研究米心水青冈的遗传多样性和遗传结构，为米心水青冈天然种质资源的保护，可持续利用和遗传改良提供科学依据。1.材料和方法1.1材料本文根据米心水青冈的分布特点，在安徽、浙江、湖北、湖南、四川、重庆、陕西、甘肃、广西、云南10个省市（自治区）进行野外标本采集，共获得米心水青冈25个居群5

8、26份样本1.2DNA的提取及检测取硅胶干燥的叶片，用CTAB[6]法提取DNA，并用1%琼脂糖凝胶电泳检测，在紫外分析仪上观察拍照。DNA主带清晰、无弥散带、RNA去除干净则认为DNA质量较高。1.3SSR引物从四篇文献中筛选引物：日本波叶水青冈（F.crenata）9对引物[7]，欧洲水青冈（F.sylvatica）6对引物[8]，日本波叶水青冈（F.crenata）16对引物[9]，长柄水青冈（F.longipetiolata）11对引物[10]。总共52对引物进行筛选。表1