基于sse指令集的串匹配算法优化

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1、基于SSE指令集的串匹配算法优化基金项目:国家973计划重点基础研究项目(2007CB311100);国家242信息安全计划项目((242)2009A43)邵妍1,2,4,刘燕兵1,3,4,刘萍1,4,郭莉1,4(1.中国科学院计算技术研究所,北京100190;2.北京邮电大学,北京100876;3.中国科学院研究生院,北京100039;信息内容安全技术国家工程实验室,北京100190);摘要:串匹配是计算机研究领域的经典问题之一,在网络安全、计算生物学、信息检索等领域发挥着关键的作用。其中,基于位并行的串匹配算法所需存储空间小、匹配速度快,但由于受

2、到机器字的限制,只适合小规模的串匹配。基于SSE系列指令集对经典的位并行算法Shift-And、BNDM进行了优化,优化算法利用SSE指令集提供的128位大位宽寄存器,将多个状态向量打包到SSE寄存器上,并通过SSE的位操作指令状态向量进行更新。在随机数据和真实数据上的测试结果显示,优化算法的匹配速度达到原算法的2倍以上。关键词:串匹配算法;位并行;SSE指令集;Shift-And;BNDM中图分类号:TP302文献标识码:A文章编号:OptimizingStringMatchingAlgorithmsbyUsingSSEInstructionsSH

3、AOYan1,2,4,LIUYan-bing1,3,4,LIUPing1,4,GUOLi1,4(1.InstituteofComputingTechnologyChineseAcademyofSciences,Beijing100190,China;2.BeijingUniversityofPostsandTelecommunications,Beijing,100876,China;3.GraduateUniversityofChineseAcademyofSciences,Beijing100039,China;3.NationalEnginee

4、ringLaboratoryforInformationSecurityTechnologies,Beijing100190,China)Abstract:Stringmatchingisaclassicresearchareaincomputerscienceandplaysanimportantroleinvariouskindoffields,suchasinformationsecurity,computationalbiology,informationretrial,etc.Bit-parallelstringmatchingalgori

5、thmsrequirelessmemoryspaceandmatchpatternsatahighspeed.However,limitedbythemachineword,theyareonlysuitableforsmall-scalestringmatching.WeoptimizedtheclassicShift-AndalgorithmandBNDMalgorithmbyusingSSEinstructions.Wepackedseveralbit-vectorsintothe128-bitregistersprovidedbySSEins

6、tructionset,andupdatedbit-vectorsbyusingSSEinstructions.Wetestedtheoptimizedalgorithmsonrandomdatasetaswellasrealdataset,andtheresultsindicatedthatthematchingspeedsoftheoptimizedalgorithmswereacceleratedtoatleasttwiceasmuchastheoriginalalgorithms’.Keywords:stringmatchingalgorit

7、hms;bitparallel;SSEinstructionset;Shift-And;BNDM1引言精确串匹配(后面简称“串匹配”)问题是计算机科学研究领域的一个经典问题。它指在文本T=t1t2…tn中找出某个给定的模式串集合P={p1,p2,…,pr}的所有出现位置,其中T和pi(1≤i≤r)是在有限字符表∑上的字符序列。串匹配技术广泛应用于网络信息安全领域,典型的应用包括:入侵检测/防御系统(IDS/IPS)、反病毒和反垃圾邮件检测(AV/AS)、网络带宽管理和服务质量(QoS)、统一威胁管理(UTM)等。近年来,随着宽带技术的发展和多媒体应用

8、的广泛流行,互联网技术得到极大的普及和发展。由于互联网协议和计算机系统的漏洞,网络安全形势日趋严峻。传统的网

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