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时间:2018-09-19
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1、基因表达数据分析的方法黑体加粗小二号居中摘要:黑体小四号加粗基因表达数据的一个重要应用是给疾病样本分类,如鉴别白血病的类型。而对成千上万个基因表达进行分析,必产生总量巨大的数据集。近年来,支持向量机(SVM)的理论已经取得重大进展,其算法实现策略以及实际应用也发展迅速,开始成为克服“维数灾难”和“过学习”等传统困难的有力手段。利用这一技术分析与整理这些基因表达数据,已有效地解决了生物信息学上这一海量数据的瓶颈问题。本文就支持向量机在基因表达数据分析方面的算法和应用进行了介绍和分析。宋体五号关键词:黑体小四号加粗生物信息学;基因表达数
2、据;支持向量机宋体五号MethodsofgeneexpressiondataanalysisTimesNewRoman三号加粗居中Abstract:TimesNewRoman小四号加粗Geneexpressiondatahasanimportantapplicationtotheclassificationofdiseasesamples,suchasidentifyingthetypesofleukemia.Theanalysisofthousandsofgeneexpressiondata,willproduceatremend
3、ousamountofdatasets.Inrecentyears,supportvectormachine(SVM)theorythatsignificantprogresshasbeenmadetowardsitsstrategyandpracticalapplicationsofalgorithmshasbeendevelopingrapidlyandbecameovercomethe"Dimensiondisaster"and"Over-study",apowerfulmeansofthetraditionaldifficu
4、lties.Usingthistechnologyanalysisandcollationofthesegeneexpressiondatahavebeeneffectivelysolvedbottleneckontheenormousbioinformaticsdata.Thispaperdiscussesthealgorithmsandapplicationofsupportvectormachineingeneexpressiondataanalysis.TimesNewRoman五号Keywords:TimesNewRoma
5、n小四号加粗Bioinformatics;Geneexpressiondata;SupportvectormachineTimesNewRoman五号13目录宋体加粗四号居中1引言一级标题黑体小四号……………………………………………………………………………(1)2生物技术的发展前景…………………………………………………………(1)2.1生物信息学的研究现状二级标题宋体小四号……………………………………………………(2)2.2基因芯片与基因表达数据…………………………………………………(2)2.2.1基因芯片三级标题宋体小四号…………
6、………………………………………………………(3)2.2.2基因表达数据……………………………………………………………(3)3基因表达数据分析的方法……………………………………………………(3)3.1支持向量机…………………………………………………………………(4)3.1.1支持向量分类……………………………………………………………(4)3.1.2分类问题的识别算法……………………………………………………(4)3.1.3支持向量机模型…………………………………………………………(6)3.2支持向量机在基因表达数据分析中的应用……………
7、…………………(6)3.2.1基因的选择:t统计法……………………………………………………(7)3.2.2降维方法:PCA和PLS…………………………………………………(7)3.2.3分类结果和评价…………………………………………………………(8)4结论……………………………………………………………………………(12)致谢………………………………………………………………………………(13)参考文献…………………………………………………………………………(13)13基因表达数据分析的方法黑体加粗小二号居中04级数学与应用数学本科班李冠
8、斌指导教师:宋杰副教授宋体小四号1引言一级标题黑体加粗小三号序号顶格,后空一格接写标题,末尾不加标点随着人类基因组计划的完成,人们逐步关注不同人群、正常与疾病状态下DNA序列的变化。DNA序列的变化是有机体种属之间存在差异或种属内存在
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