ipa1基因在高等植物中的同源~

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1、题目：IPA1基因在高等植物中的同源性生物信息学分析姓名：邹玉学号：201107010056学院：生命科学与农学学院专业：生物科学年级班级：2011级一班指导教师：王雪芹2015年月日毕业论文（设计）作者声明本人郑重声明：所呈交的毕业论文是本人在导师的指导下独立进行研究所取得的研究成果。除了文中特别加以标注引用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写的成果作品。本人完全了解有关保障、使用毕业论文的规定，同意学校保留并向有关毕业论文管理机构送交论文的复印件和电子版。同意省级优秀毕业论文评选机构将本毕业论文通过影印、缩印、扫描等方式进行保

2、存、摘编或汇编；同意本论文被编入有关数据库进行检索和查阅。本毕业论文内容不涉及国家机密。论文题目：IPA1基因在高等植物中的同源性生物信息学分析作者单位：生命科学与农学学院作者签名：（201107010056）2015年月日目录摘要2引言31、材料和方法51.1材料来源序列51.2IPA1基因同源性分析所使用的软件及操作步骤61.2.1水稻同源性分析软件及操作步骤61.2.2水稻IPA1序列比对软件及操作步骤71.2.3水稻IPA1系统发育树的构建软件及操作步骤72、结果与分析82.1IPA1蛋白序列的同源性分析82.1.1IPA1蛋白序列的同源搜

3、索82.1.2IPA1蛋白序列的同源性比对102.2IPA1编码序列的同源性分析122.2.1IPA1编码序列的同源搜索122.2.2IPA1编码序列的同源性比对123、讨论与结论14参考文献：15致谢16IPA1基因在高等植物中的同源性生物信息学分析摘要：IPA1基因控制水稻的株高增加、茎秆粗壮、分蘖数减少、穗粒数和干粒重量的显著增加。本研究通过对15科26种植物的IPA1基因的同源性分析，构建了其系统发育树。基于其氨基酸序列所构建的系统发育树结果表明：来自同一科的物种如禾本科、蔷薇科、棕榈科的物种均很好地聚为了不同的分支，且支持率高。进一步，我

4、们以禾本科为主基于其CDS序列构建了系统发育树，禾本科的物种很好地聚为一支，支持率为100%。我们的研究结果表明IPA1在高等植物中具有较高的同源性，尤其是在禾本科类群当中，这对于我们进一步研究水稻及其它禾本科物种的增产具有一定的揭示意义。关键字：IPA1同源分析序列比对系统发育树ThehomologybioinformaticsanalysisofIPA1genesinplantsAbstract:IPA1genescontroltheplantheightincreasing,thestemofhaulm,thereductionoftille

5、rnumber,asignificantincreaseingrainnumberanddryweightofgraininrice.ThisstudyconstructeditsphylogenetictreebythehomologyanalysisofIPA1of26speciesrepresenting15families.Thephylogenetictreeconstructedbasedontheresultsofitsaminoacidsequenceshowedthat:thespeciesthatfromthesamefamil

6、ysuchasPoaceae,RosaceaeandPalmsgatheredintodifferentbranchesclearly,andthesupportvalueswerehigh.Further,basedonthegrassyCDSsequenceweconstructeditsphylogenetictree,grassyspeciesclusteredtogetherwell,andthesupportvaluewas100%.OurresultsshowedthatIPA1havehighhomologyinplants,esp

7、eciallyingrassyclassmasses,whichrevealedacertainsenseforustofurtherincreaseproductionofriceandotherPoaceaespecies.Keyword:IPA1HomologousanalysisSequenceAlignmentPhylogenetictree引言全世界有将近一半的人以米饭作为主食，超过10000种水稻品种提供全球人均膳食能量供应的四分之一。当今全球面临着土地资源日趋减少，世界人口特别是中国人口不断增加的情况，因此如何提高水稻的产量和品质从

8、而满足全球人口需求的持续增长就变得越来越重要。为了能够实现水稻产量的第三次突破，使现有的品种在高产基础上进一步实现更高产的