资源描述：
《利用rna-seq技术鉴定拟南芥不定芽再生相关的转录因子》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在教育资源-天天文库。
1、利用RNA-Seq技术鉴定拟南芥不定芽再生相关的转录因子http://journals.im.ac.cn/cjbcnDOI:10.13345/j.cjb.140529April25,2015,31(4):552?565?2015ChinJBiotech,Allrightsreserved王兴春1,2，陈钊3，樊娟1，何苗苗1，韩渊怀2,4，杨致荣31山西农业大学生命科学学院，山西太谷0308012山西农业大学农业生物工程研究所，山西太谷0308013山西农业大学文理学院，山西太谷0308014农业部黄土高原作物基因资源与种质创制
2、重点实验室，山西太原030031摘要:转录调控是不定芽再生过程的主要调控方式之一，但具体机制尚需进一步研究。为此，利用基于IlluminaHiSeq?2000测序平台的RNA-Seq技术分析了不定芽再生缺陷突变体be1-3和野生型WS在愈伤形成和不定芽再生过程以及野生型WS从脱分化向再分化转变过程差异表达的转录因子(Transcriptionfactor，TF)编码基因。结果表明：与野生型WS相比，be1-3在脱分化过程差异表达的TF编码基因有155个，其中表达量上调的97个，表达量下调的58个；在再分化过程差异表达的TF编码基
3、因有68个，其中表达量上调的40个，表达量下调的28个；而在野生型WS从脱分化向再分化转变的过程，总共检测到231个差异表达的TF编码基因，包括160个表达量上调的基因和71个表达量下调的基因。其中，MYB-related(v-myb禽成髓细胞瘤病毒癌基因)家族的不定芽相关转录因子基因ART1在be1-3突变体脱分化阶段的表达量提高了3217倍，是表达量上调最大的TF编码基因。进一步研究发现，该基因过量表达导致愈伤形成和不定芽再生缺陷，并抑制了幼苗特别是主根的生长发育，表明该基因是愈伤形成和不定芽再生过程的一个负调控因子。本研究
4、不仅加深了人们对不定芽再生转录调控机制的认识，而且为今后不定芽再生相关转录因子的研究提供了大量候选基因信息。关键词:不定芽再生，愈伤组织形成，RNA-Seq，转录因子，转录调控，拟南芥Received:November4,2014;Accepted:December11,2014Supportedby:NationalNaturalScienceFoundationofChina(No.31100235),NaturalScienceFoundationofShanxi(No.2013011028-1),ShanxiSchola
5、rshipCouncilofChina(No.2010050).Correspondingauthor:XingchunWang.Tel:+86-354-6287191-307;E-mail:wxingchun@163.comZhirongYang.Tel:+86-354-6288341;E-mail:zryangsx@163.com国家自然科学基金(No.31100235)，山西省自然科学基金(No.2013011028-1)，山西省回国留学人员科研资助项目(No.2010050)资助。网络出版时间：2015-02-03网络出
6、版地址：http://www.cnki.net/kcms/detail/11.1998.q.20150203.1622.003.htmlXingchunWang1,2,ZhaoChen3,JuanFan1,MiaomiaoHe1,YuanhuaiHan2,4,andZhirongYang31CollegeofLifeSciences,ShanxiAgriculturalUniversity,Taigu030801,Shanxi,China2InstituteofAgriculturalBioengineering,ShanxiA
7、griculturalUniversity,Taigu030801,Shanxi,China3CollegeofArtsandSciences,ShanxiAgriculturalUniversity,Taigu030801,Shanxi,China4KeyLaboratoryofCropGeneResourcesandGermplasmEnhancementonLoessPlateau,MinistryofAgriculture,Taiyuan030031,Shanxi,ChinaAbstract:Transcriptiona
8、lregulationisoneofthemajorregulationsinplantadventiousshootregeneration,buttheexactmechanismremainsunclear.Inourstudy,theRNA-seqtec
