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时间:2018-07-31
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1、2018年硕士生入学考试专业基础课大纲考试科目名称:基因组信息学与生物统计考试科目代码:814一、考试要求掌握常用的生物统计方法,了解基因组信息学中的基本数据类型,能运用所学的基本理论和实验技能,说明和解决基因组信息学中相关的问题。二、考试内容(一)《基因组信息学》部分1)基因组信息学中生物学基础a.DNA的结构、分子生物学中心法则b.基因组结构与基因表达调控2)人类基因组及基因组数据库a.人类基因组计划及测序策略b.NCBI及Ensembl数据库、UCSC基因组浏览器c.ENCODE计划、TCGA计划3
2、)基因组信息分析a.真核生物基因组特点b.基因组序列分析c.基因识别方法d.非编码区域分析与调控元件识别4)基因芯片数据分析a.基因芯片分类与数据表示b.基因芯片数据预处理c.基因表达差异的显著性分析d.基因表达谱聚类分析e.基因表达数据的分类分析f.主成分分析PCA5)新一代高通量测序数据分析a.了解新一代高通量测序技术的基本原理b.了解ChIP-Seq技术的基本原理及基本分析工具(Bowtie、MACS)c.了解RNA-Seq技术的基本原理及基本分析工具(tophat、cufflinks)(二)《生物
3、统计》部分1)生物统计学的基本知识a.生物统计学概念b.生物统计学术语2)实验资料的整理与统计描述a.实验资料的收集与整理a.统计图表的应用b.实验资料特征数的计算3)概率与概率分布a.概率基础知识b.几种常见的理论分布(正态分布,二项分布,泊松分布)c.抽样分布的特征以及中心极限定理4)统计推断a.假设检验的原理与方法b.样本平均数的假设检验c.样本频率的假设检验d.参数的区间估计与点估计e.方差的同质性检验5)Χ2检验a.Χ2检验的原理与方法b.正态分布和二项分布的拟合优度检验c.计数资料的Χ2检验6
4、)方差分析a.方差分析的基本原理b.单因素方差分析c.二因素方差分析d.方差分析的基本假定和数据转换7)简单直线回归与相关分析a.回归和相关的概念b.直线回归分析c.直线相关8)多重线形相关与回归a.多重线性相关与回归中涉及的统计量的概念和意义b.多重回归分析c.多重相关分析一、试卷结构a)考试时间180分钟,满分150分b)基因组信息学与生物统计各占75分c)题型结构:a:填空题(30分)b:解答题(包括简答与计算题)(120分)二、参考书目1.乔纳森.佩夫斯纳著,孙之荣译,《生物信息学与功能基因组学》
5、,化学工业出版社。2.孙啸、陆祖宏、谢建明,《生物信息学基础》,清华大学出版社。3.李春喜,王志和等,《生物统计学》(第四版),科学出版社。4.杜荣骞编,《生物统计学》第三版,高等教育出版社
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