事故灾害与自然灾害突发事件应急处理预案

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1、Summerresearchin901602M13PhageDisplay陳慧宇M13PhageDisplay901602陳慧宇前言:蛋白質是目前公認在體內負責主要作用的分子單位,尤其是在DNA序列資料庫逐漸完整同時,我們更深刻體認到蛋白質表現的重要性及多樣性,不同的蛋白質之間對生物體也會造成不一樣的影響,即使相同的蛋白質在不同的細胞中,或是不同的環境之下,或是有不同的表現形式與結構,都會對生物體造成不一樣的影響,同時生物體內的其他分子,如糖類、脂質、DNA、各種離子……,也會對蛋白質之表現有所影響,或是在不同的蛋白質之間,彼此的交互作用之下,更顯複雜,要在生物體內,尤其

2、是真核生物之中,看到單一蛋白質的作用,是非常困難的。因此目前關於蛋白質的研究,最常用來表現蛋白質及觀察蛋白質作用的方法,就是yeasttwohybrid以及phagedisplay兩種。前者是利用yeast的轉錄調控及蛋白質間的相互作用來進行有關蛋白質的選殖工作,如利用GAL4這個transcriptionactivator具有兩個domain—DNAbindingdomain及activationdomain,將這兩個domain的genes分別接上不同蛋白質的序列,包含一個是已知的蛋白質,另一個則是未知的希望篩選出來的蛋白質,再host中加上可篩選的基因,如使yeas

3、t變成是His-,並準備缺乏His的培養基,最後使兩個GAL4的domains能夠在yeast中表現,如果最後能夠在缺乏His的培養基中養出yeast,就代表了這個未知的蛋白質能和已知的蛋白質作用,也就是我們所希望選質出來的蛋白質。而後者phagedisplay則是利用把蛋白質表現在phage的外表上,然後利用這種攜帶了特定的蛋白質的phage,利用蛋白質彼此之間的交互作用去篩選所想要的其他蛋白質,例如,如果在phage表面接上antibody,就可以在固相的管子、plate……上固定會和其作用的antigen,來篩選出它的單株及多株抗體;而如果是在phage表面接上an

4、tigen,則目的相反,可以得到固定在固相的antibody所認得的epitope;如果在表面接上enzyme,也可以篩出其可作用的受質。篩選後的結果完全取決於所接於phage表面的蛋白質為何,phagedisplay的基本目的是要在原來極多的目標中,將可能的範圍縮小到極小、甚至是一個目標,只要是符合此目的的都可以使用phagedisplay的方法來篩選蛋白質,是一個很具有應用性的蛋白質篩選方法。而我們實驗室所使用的就是phagedisplay的方法,之後再進一步去篩選我們所需要的蛋白質以進行其他的實驗,而我這個暑假也就是藉phagedisplay這個實驗題目,學習了許多

5、相關的實驗技術。-1-InInstituteofBotany,AcademiaSinica-R425Summerresearchin901602M13PhageDisplay陳慧宇實驗背景:一般而言,phagedisplay中可以使用的有很多,但是大多都是filamentousphage,像是VCS-M13,M13KO7、M13mp19……等等,因為本身所帶有的genes很少,也知道表現proteins的具體功能,加上這種phage在感染bacteria時並不會造成他們的死亡,而只是減緩他們分裂生長的速度,所以想取出bacteria中的phage時只要挖取一部份的plaq

6、ue即可;而我們實驗室所選擇使用的是M13filamentousphage,是一種最wildtype的filamentousphage。M13filamentousphage的長約1um,直徑小於10nm,是一種單股(singlestrand)環狀DNA的phage,大小約為6400bp,只能infect具有pili的bacteria,所以通常會用Ecoli.來養M13phage,現在也已經知道M13phage共有10種蛋白質,標示為pI-pX,分別負責不同的功用。和phage外表呈現有關的蛋白質有pIII、pVI、pVIII、pVII及pIX(圖一)。圖一:M13fil

7、amentousphage的外表結構圖。pVIII是數量最多的,一個phage中有約2700個pVIII,其主要功能就是包住M13phage的DNA;而其他四種蛋白質中,pIII及pVI在一端,pVII及pIX在另一端,這兩端分別是M13phage進、出bacteria時所要用到的,四種蛋白質的數量在每個phage各為五個,而這些蛋白質在bacteria中translate出來後,就會跑到membrane上,待脫出時包裹ssDNA。另外五個蛋白質中,pV是負責在bacteria中包裹ssDNA,到了要從bacteria離開時才

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