运用dnastar比对序列

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时间:2018-07-14

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1、方法一在DNAstar中点击“MegAlign”程序,后出现如下界面点击“File”选择“Entersequences”出现如下界面下面选择框中选取“Alloftheabove”即可。在上面浏览并选中目标序列(如图04060582(3)M13+_A12.seq),再点击“打开”。完成后再以同样的方法打开第二条序列,所选中的目标序列均显示在“selectedsequences”框中。此时点击“Done”跳至如下界面此时即可进行两两比对。如图对测序结果“04060582(3)M13+_A12.seq”与NCBI中的序列“AK352687.1ORF.seq”进行比

2、对。按住键盘Ctrl键选中这两条序列此时点击“Align”—“onepair”再选择第一个或第二个选项,(一般可先尝试第二种),出现界面点击OK转至界面此时即比对完成,再点击左上角,出现如下界面在选取showNames和showcontext后点击上面蓝色小方块后再点击cosensuscolor后的黑色方块,点击上面红色小方块后再点击Mismatchcolor后的黑色方块,出现如下界面;再点将该浮框关闭,此时刻观察测序结果:蓝色区为两者一致区。红色区位不相同区域。

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