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时间:2018-07-13
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1、1章生物化学基础一、一句话问题1.生命形式虽然千差万别,在就化学本质而言,他们具有一致性。2.生命体区别于非生命体的四个基本特征。①化学成分的同一性②严整有序的结构③新陈代谢④自我复制的能力(P1)3.有机体遵行热力学第一定律,通过增大环境的无序而使得自身有序化。4.生命体的信息流基本类同。5.根据SSURNA序列细胞分为三类,细菌、古细菌和真核细胞。古细菌与真核细胞更接近。6.线粒体和叶绿体是通过内共生进入真核细胞。线粒体来源于紫细菌,叶绿体来源于蓝细菌。7.细胞与细胞器<--超分子复合体<----大分子<--单体8.生物分子结构
2、决定反应性、结构决定功能、结构也代表一种信息。9.细胞内是一个水环境,水为细胞内生化反应提供了反应介质,甚至直接参与反应。第2章氨基酸与肽1、概念蛋白氨基酸:参与蛋白质组成的氨基酸(P17)非蛋白氨基酸:不参与蛋白质组成的氨基酸(P17)兼性离子(偶极离子):氨基酸等电点(pH=pI)时,羧基以-COO-,氨基以-NH3+形式存在。这样的氨基酸分子含有一个正电荷和一个负电荷,称为兼性离子(P20)pI(等电点):溶液中氨基酸处于净电荷为零时的pH成为等电点(P22)Paralogues:并(旁)系同源:一个个体中既有一定关系却又不相
3、同的蛋白质(Iftwoproteinswithinafamily(thatis,twohomologs)arepresentinthesamespecies,theyarereferredtoasparalogs(并系同源))Orthologues:直系同源:不同种属中具有相同功能的蛋白质(Homologsfromdifferentspeciesarecalledorthologs(直系同源))PITC:苯异硫氰酸酯(烃化剂,氨基酸反应,P23;肽段氨基酸序列测定,降解试剂,P50)DNP:二硝基苯酚(P48)2、简答1、写出20中
4、氨基酸的三字母和单字母缩写,哪些属于酸性,哪些属于碱性,哪些含羟基,哪些含硫元素。酸性氨基酸(及其酰胺):①天冬氨酸(AspD)②谷氨酸(GluE)③天冬酰胺(AsnN)④谷氨酰胺(GlnQ)碱性氨基酸:①赖氨酸(LysK)②精氨酸(ArgR)含羟基或硫氨基酸:①丝氨酸(SerS)②苏氨酸(ThrT)③半胱氨酸(CysC)④甲硫氨酸(MetM)中性氨基酸:①丙氨酸(AlaA)②甘氨酸(GlyG)③缬氨酸(ValV)④亮氨酸(LeuL)⑤异亮氨酸(IleI)芳香族氨基酸:①苯丙氨酸(PheF)②酪氨酸(TyrY)③色氨酸(TrpW)杂
5、环氨基酸:①组氨酸(HisH)②脯氨酸(ProP)1、什么是sanger反应,什么是Edman反应,它们在蛋白质测序过程中有何用途?Sanger反应:二硝基氟苯(FDNB)法。多肽的游离末端氨基与FDNB反应生成二硝基苯多肽(DNP-多肽)(α-氨基酸很容易与FDNB作用,生成稳定的黄色DNP-多肽可用于鉴定多肽链的N-末端残基(P48)Edman反应:(Edman化学降解法)降解试剂苯异硫氰酸酯(PITC)与肽键反应只标记和除去N-末端残基,肽链的其余肽键不被水解。N-末端残基被除去并鉴定后,剩下的肽链暴漏出一个新的N-末端残基,
6、可与PITC发生第二轮反应。(P50)可用于肽段氨基酸序列的测定1、如何测定蛋白质的序列?亚基还原解离,N末端确定,氨基酸组成确定,两组以上酶解,Edman降解确定每一个小片段的序列,序列拼接,对角线电泳确定二硫键位置。(P48-P51)第3章蛋白质的空间结构1、概念肽键:一个氨基酸的α-羧基与另一个氨基酸的α-氨基脱水缩合而成的肽平面:肽键的实际结构是一个共振杂化体,C—N键具有双键性质,所以肽键是一个平面,称为肽平面(P44)ψ角:绕Cα—C键轴旋转的二面角(N—Cα—C—N)称为ψφ角:绕N—Cα键轴旋转的二面角(C—N—Cα
7、—C)称为φ(P58)超二级结构:蛋白质中若干相邻的二级结构元件组合在一起,彼此相互作用,形成种类不多、有规则、稳定的二级结构组合或结构串,称为超二级结构(或折叠花式、折叠单位)(P63)结构域:含数百个氨基酸残基的多肽链经常折叠成两个或多个稳定的、相对独立的球状实体,称为(结构)域(P64)2、简答1、如何确定蛋白质的空间结构①X射线衍射②核磁共振(NMR)③圆二色性(CD)④荧光偏振⑤拉曼光谱⑥扫描隧道显微技术(P56)2、蛋白质的二级结构形式主要有哪几种,它们结构特点如何,主要由那种最用了驱动。①α螺旋:重复结构、相互之间紧密
8、盘曲成稳固的右手螺旋,肽平面维持刚性结构(P59)②β片(β折叠):重复性结构,有平行和反平行两种方式,多肽链充分伸展,构象稳定(P60)③β转角:非重复性结构,其构象是由第二残基α碳和第三残基α碳的二面角所规定的(P61)④无规则卷
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