新基因flj39061在淋巴瘤中的表达及其功能分析

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1、新基因FLJ39061在淋巴瘤中的表达及其功能分析：严玲玲，朱涛，白向阳，卢运萍，周剑锋，马丁【摘要】目的研究淋巴瘤与反应性增生淋巴结的基因表达差异,并对淋巴瘤高表达基因FLJ39061进行初步分析。方法将淋巴瘤淋巴结标本和反应性增生淋巴结标本液氮速冻切片，使用激光显微切割技术分离淋巴细胞，提取淋巴细胞中的mRNA与表达谱芯片杂交，通过信号扫描、处理后获得两者的表达差异基因。用生物信息学方法对一条有显著性差异的新基因FLJ39061进行初步分析。结果表达谱芯片发现了152条差异表达基因。对淋巴瘤相关基因FLJ39061的性质进行了有效的预测，基本明确了该基因编码蛋

2、白为一核蛋白，很可能是人MAP激酶激活的蛋白激酶2的前体或异构体。结论FLJ39061可能作为激酶磷酸化底物调节细胞代谢，与淋巴瘤发生有关，可作为治疗靶点做进一步的功能研究。【关键词】淋巴瘤；表达谱芯片；FLJ39061；生物信息学；MAPK　　ExpressionofaNovelGeneFLJ39061inLymphomaandItsFunctionAnalysis　　Abstract：ObjectiveToexplorethedifferentialexpressedgenesinlymphomaandreactivelymphnodeandperformed

3、aninitialanalysisonanovelgene.HypetheticalProteinFIJ39061，phnodeoflymphoma.MethodsThesamplesaintaintheintegrityofmRNA.ThemRNAofthetissuefromthelymphomaandreactivelymphnodearemarkedicroarray,andthedifferentialexpressedgenesareobtained.Initialbioinformaticsanalysisisperformedonanovelgen

4、enamedFLJ39061iclocalization,thephysicalandchemicalcharacteristicsoftheputativeprotein,subcellularlocalization,functionaldomainandsoonarepredicted,andthesystematicevolutionanalysisisperformedonthesimilarproteinsamongseveralspecies.ResultsUsingexpressionprofilemicroarray,152differentia

5、lexpressedgenesareuncovered.EfficientbioinformaticsanalysishavefundamentallyidentifiedthatFLJ39061isanuclearprotein,andprobablyisprecursororisomerofMAPkinaseactivatedproteinkinase2.ConclusionBybioinformaticsanalysis,FLJ39061mayinvolvedinthephosphorylationregulation.Itisanticipatedtha

6、tthisprojectolecularmechanismsintheneoplastictransformationoflymphomaandtheneisingmoleculartargetsfortherapeuticintervention.　　Keyphoma；Expressionprofilemicroarray；FLJ39061；Bioinformatics；MAPK　　0引言近年来，恶性淋巴瘤发病有渐增趋势，而其发病机制至今仍不清楚。随着基因芯片、基因表达系列分析（SAGE）、抑制性消减杂交（SSH）等高通量研究方法的发展，使得从分子调控水平上研究

7、肿瘤相关的分子机制和调控途径成为可能。这里使用基因芯片对激光显微切割获得的淋巴瘤淋巴结样本的基因表达谱进行分析，发现一个在T细胞淋巴瘤淋巴结中高表达的基因FLJ39061，并对它进行初步的生物信息学分析研究，基本明确了这个基因的生物功能与意义，为今后进一步的分子生物学实验提供了信息和方法指导。　　1材料与方法　　1.1材料6例淋巴瘤淋巴结标本和反应性增生淋巴结标本于华中科技大学同济医学院附属同济医院2005年9月～2005年12月血液科患者的手术标本，其中3名术后病理结果证实为淋巴瘤（2名为B细胞淋巴瘤，1名为T细胞淋巴瘤），另3名淋巴结肿大患者病理鉴定为反应性增

8、生。微量m