柑橘黄龙病可视化lamp检测技术的建立及应用

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1、热带作物学报2014,35(5):918-924ChineseJournalofTropicalCrops柑橘黄龙病可视化LAMP检测技术的建立及应用王贤达1,22232*,林雄杰,胡菡青,王宗华,范国成1福建农林大学植物保护学院,福建福州3500022福建省农业科学院果树研究所,福建福州3500133福建农林大学,福建福州350002摘要建立柑橘黄龙病(HLB)可视化环介导等温扩增(LAMP)检测方法,为HLB的快速检测提供有力的技术支持。根据LAMP技术原理,针对柑橘黄龙病菌16SrDNA靶序列的6个位点设计4条特异性引物,通过

2、对反应体系和反应条件的优化,并在反应前的体系中加入1∶10的钙黄绿素(calcein)和氯化锰(MnCl2)混合液作为荧光显色剂,建立可视化LAMP检测技术,同时对该技术的特异性、灵敏度和样品检测进行了测试。该检测方法具有很高的特异性,反应体系中除了HLB具有特异性的扩增,产生黄绿色荧光扩增产物,其他供试菌株均无特异扩增。对柑橘黄龙病菌总DNA的检测限为1.51×10-3ng/μL,而对含有目的基因的CG-pMD18-T质粒DNA的检测限为2.12×10-6ng/μL,与定量PCR灵敏度相当,而比常规PCR灵敏度高1000倍。利用可

3、视化LAMP技术和定量PCR对来自漳州、南平、福州等地的样品进行检测,结果2种技术的检出率均为76.7%,符合率达到100%。关键词柑橘黄龙病菌;钙黄绿素;环介导等温扩增(LAMP);可视化中图分类号S436.66文献标识码AEstablishmentandApplicationofVisualLoop-mediatedAmplificationAssayonCitrusHuanglongbing1,22232*WANGXianda,LINXiongjie,HUHanqing,WANGZonghua,FANGuocheng1Plan

4、tProtectionCollege,FujianAgricultureandForestryUniversity,Fuzhou,Fujian350002,China2InstituteofFruitTreeSciences,FujianAcademyofAgriculturalSciences,Fuzhou,Fujian350013,China3FujianAgricultureandForestryUniversity,Fuzhou,Fujian350002,ChinaAbstractAnovelmethodnamelyvisu

5、alloop-mediatedisothermalamplification(LAMP)wasestablished.ItwouldprovidestrongsupportforHuanglongbing(HLB)quickdetection.ThemethodisbasedonLAMPreaction.Theconservedregion,16SribosomalDNAinthegenomicDNAofCandidatusLiberibacterasiaticus(Las)wasamplifiedbyasetoffourspeci

6、ficprimersthatrecognizesixdistinctsequencesoftarget.CalceinandMnCl2(1∶10)reagentwereaddedintothemixbeforereactionandusedinLAMPproductjudgmentwithnakedeyes.AvisualLAMPmethodwasestablishedbytheoptimizedreactionsystemsandconditioninthisstudy,andthespecificityandsensitivit

7、ywastestinthefield.ThisvisualLAMPmethodwastremendouslyhighspecificity.OnlyLasinthereactionsystemwasspecificallyamplifiedwithgreenyellowfluorescenceproducts,theothersampleswasnotamplified,andwithoutanyproducts.ThelowestdetectionconcentrationsofLasDNAandLasplasmidDNAinth

8、emethodwere1.51×10-3ng/μLand2.12×10-6ng/μL,respectively.ThesensitivityofvisualLAMPwasequivalencywithreal-timePCRand10

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