基于MHC-DRB基因的秦岭川金丝猴（Rhinopithecus roxellana）适应性进化研究.pdf

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1、分类号０６９７，：ＱＷ学校代码：１；：２０１２３１５４８密级公开学号．．ｉ早．＿二？．看如乂＾．聲－％‘？与－．‘，，式常，；遣运聖亨恆硕±巧交Ｓ＇ＰＥＣＩＡＬＩＺＥＤＭＡＳＴＥＲＳＤＩＳＳＥＲＴＡＴＩＯＮ基于ＭＨＣ－ＤＲＢ基因的秦岭川金丝猴，Ｒｈ？（ｉｎｏ口ｉｔｈｅｃｕｓｒｏｘｅＵａｎａ）适应性选气片研究，＊．学科名称：生物工程专业学位类别：工程硕壬作者：陈丹指导老师：李保国教授西北大学学位评定委员会

2、二〇—五年西北大学学位论文知识产权声明书本人完全了解西北大学关于收集、保存、使用学位论文的规定。学校有权保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和电子版。本人允许论文被查阅和借阅。本人授权西北大学可［＾将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可Ｗ采用影印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文。同时授权中国科学技术信息研究所等机构将本学位论文收录到《中国学位论文全文数据库》或其它相关数据库。保密论文待解密后适用本声明。：签名；Ｗ学位论文

3、作者签名…―．苗夺＿指导教师年月＾曰化年以曰押ｉ灰／月西北大学学位论文独创性声明本人声明：所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研巧成果。据我所知，除了文中特别加［＾标注和致谢的地方外，本论文不包含其他人己经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得西北大学或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料一。与我同工作的同志对本研究所做的任何贡献均己在论文中作了明确的说明并表示谢意。学位论文作者签名：节年６月２＾曰摘要一川金丝猴说ｅｃ

4、ｗｒｏｘｅ／／ａｎａ）是我国特有级额危野生保护动物，其主要分布在我国甘肃南部、湖北神农架Ｗ及陕西秦岭三个隔离地区的高山丛林中。其中秦岭地区川金丝猴大约有３８００到４０００只。上个世纪５０，６０年代，长期的山林砍伐Ｗ及大范围的道路修建，造成了秦岭川金丝猴生境的大面积破碎化，形成了地理隔离的小种群，导致秦岭地区川金丝猴基因遗传多样性的丧失，容易受到疾病与环境的影响。因此研究秦吟川金丝猴的种群遗传多样性化及适应性进化情况，对于制定该物种有效的保护策略有着重要的意义。本研究通过

5、高通量测序与ＰＣＲ－ＳＳＣＰ基因分型相结合的方法，对来自秦岭地区４个种群的１０５份川金丝猴样品进行研究，共分离得到２９条等位基因，其中１３，表明秦岭川金丝猴ＤＲＢ基因的遗传多样性较高条为新发现的等位基因。结合川金丝猴全基因组测序的结果，将ＤＲＢ的等位基因归入两个基因座上（ＤＲＢ１，ＤＲＢ２）。在对秦岭川金丝猴的进化分析中发现：本研究所得到的等位基因并不与其他近缘物种的假基因聚成一簇，在序列中也不存在终止密码子。此外，川金丝猴ＤＲＢ基因并不独立的一聚在起一，而是存在着跨物

6、种进化，这也是受到平衡选择的个重要证据。在对平衡选择进行检验时／，发现在ＤＲＢ１与ＤＲＢ２两个位点的抗原结合位点ＡＢ巧处（，如成的值大于１，表明这些位点受到了平衡选择的作用。此外我们还通过最大似然法对密码子进化情况进行检测，发现存在选择压力的模型均优于不具有选择压力的模型，且在Ｍ２ａ和Ｍ８两个模型中均检测到多个受到较强选择压力的位点。这也说明了平衡选择是维持秦岭川金丝猴ＭＨ一Ｃ基因遗传多样性的个重要机制。本研究发现，秦岭川金丝猴的－ＤＲＢ基因具有较高的多态性ＭＨＣ，验证

7、了平衡选择在维持ＭＨＣ基因多样性中起到了重要的作用。ＭＨＣ基因与脊椎动物的免疫功能密切相关，多样性也与不同地理种群对不同抗原的识别能力有着密切的联系，因此对秦岭川金丝猴的适应性进化研究对于今后更好的保护送一频危物种有着重要的意义。关键巧：川金丝猴；ＭＨＣ基因；遗传多样性；平衡选择ＩＡｂｓｔｒａｃｔＧｏ－诚ｒａｌｄｅｎｓｎｕｂｎｏｓｅｄｍｏ地ｅｙ欠知＂〇６仁似ｃｅ／／。巧幻）ｉｓ泣ｒａｒｅａｎｄｅ打ｄａｎｅｒｅｄｓｐｅｃｉｅｓ（只ｇｅｎｄｅｍｉｃ

8、化Ｃｈｉｎａ．ＴｈｅｙｄｉｓｔｒｉｂｕｔｅｓｉｎＳｉｃｈｕａｎ／Ｇａｎｓｕ，ＳｈａｎｘｉＱｉｎｌｉｎｇａｎｄＨｕｂｅｉＳｈｅｎｎｏｎｇｊｉａ．Ｔｈｅｒｅａｒｅａｂｏｕｔ３９ｇｒｏｕｐｓｉｎＱｉｎｌｉｎｇＭｏｕｎｔａｉｎｓ．Ｉｎ１９６０ｓ，ｄｕｅ化ｈｕｍａｎａｃｔｉｖｉｔｉｅｓ，ｔｈｉｓｓｐｅｃｉｅｓｓｕｆｆｅｒｉｎｇｆｒｏｍｈａｂｉｔａｔｌｏｓｓａｎｄｆｒａｇｍｅｎｔａｔｉｏｎｔｈａｔｗｉｌｌｃａｕｓｅｔｈｅｉｒｇｅｎ