水稻地方品种月亮谷与稻瘟病菌的互作转录组分析.ppt

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1、试验设计与方差分析12单因素试验设计全分组试验设计:完全随机排列设计;随机区组设计;拉丁方设计。不全分组试验设计:分格设计完全随机排列设计(CompletelyRandomizedDesign,CRD)4种处理方法下(处理A,B,C,D),进行5次重复的CRD田间试验设计。12345678910111213141516171819201.确定所需试验点总数n,n由试验处理方法的数量和试验重复次数决定。2.随机分配处理方法到各个试验点用计算机产生20个随机数,分别对应1-20号田。随机数表法选择20个随机数后,按选择顺序编排序号随机数序号随机数序号937

2、1918111492772129083243133614494149535704157496549161807957179518157180189571194271022620随机数表法选择20个随机数,按大小顺序排序随机数序号大小顺序随机数序号大小顺序9371179181116149227721214908315243136636147494149953519704151274961354916101807495717209518181571830189157119114271082262053.将选定的随机数按从小到大排列顺序。4.将按大小排序后的

3、随机数进行分组,即将第三步中排列好的n个数分为t组,每组中含有r个数。将选择的20个随机数按选择顺序进行分组组别各组内的田块顺序号117215719213418183161469124102031151B2A3D4B5D6C7A8B9C10D11D12C13B14C15A16C17A18B19A20D5.数据分析试验重复因子水平12345平均数Ax11x12x13x14x15Bx21x22x23x24x25Cx31x31x32x33x34Dx41x41x42x43x44(总平均)方差来源自由度平方和(SS)均方(MS)F值处理效应t-1SS处理效应SS

4、处理效应/t-1MS处理效应/MS误差试验误差tr-tSS误差SS误差/tr-t总和(r)(t)-1SS总案例分析通过田间试验判别6种不同化学杀虫剂对某地区水稻灰飞虱和水稻主要蛀茎害虫的防控效果(Gomez和Gomez,1984)。基本情况:针对以水稻灰飞虱为代表的主要水稻蛀茎害虫的化学防治措施,选用6种不同化学杀虫剂(或不同剂量)在一代成虫扩散高峰期和第2、3代若虫盛孵高峰期,进行集中歼灭,以控制害虫直接为害和传毒。在水稻收获期,调查各试验点平均水稻产量来反映不同杀虫剂(或不同剂量)对害虫的化学防控效果。单因子试验的一般概述在一个试验中只考察一个因子

5、A及其r个水平A1,A2,…,Ar.在水平Ai下重复mi次试验,总试验次数n=m1+m2+…+mr.记yij是第i个水平下的第j次重复试验的结果,这里i——水平号,j——重复号.经过随机化后,所得的n个试验结果列于下表:单因子试验的数据单因子试验的三项基本假定1.正态性。在水平Ai下的数据yi1,yi2,…,yimi是来自正态总体的一个样本,i=1,2…,r.2.方差齐性。r个正态总体的方差相等,即          .3.随机性。所有数据yij都相互独立.单因子试验所涉及的多个正态总体单因子试验的统计模型其中是因子A的第i个水平下第j次试验结果;是因

6、子A的第i个水平的均值,是待估参数;是因子A的第i个水平下第j次试验误差, 它们是相互独立同分布的随机变量.由此可知:单因子试验的三项基本假定用到试验数据yij上去,可得到如下统计模型:单因子方差分析总平方和的分解公式总平方和的分解公式各平方和的计算均方和F检验方差分析表单因素方差分析的实现Excel数据统计分析R函数aov()?aovaov(formula,data=NULL,projections=FALSE,qr=TRUE,contrasts=NULL,...)例利用四种不同配方A1,A2,A3,A4生产出来的钾肥,请采用适当的试验方法检测其对T

7、R杂交稻产量的影响(不考虑其他因素)。若试验实施后,测得不同配方下TR杂交稻的产量如下表所示,问:四种配方的钾肥对TR杂交稻的产量是否有显著性差异?配方产量(kg)A11600161016501680170017001780A215001640140017001750A316401550160016201640160017401800A4151015201530157016401600例以multcomp包中的cholesterol数据集为例,检验5种治疗法降低胆固醇效果间是否有显著性差异?cholesterol数据集包含了5种治疗方法,其中前三种的药

8、物相同,治疗方法不同,分别是20mg一天1次,10mg一天2次,5mg一天4次,剩下为另外两种

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