中华骨髓库CWD表2.2版本

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1、中国常见及确认的HLA等位基因表(CWD)2.2版本中华骨髓库CWD表编撰组2016-02-15前言自1958年发现第一个人类白细胞抗原(HLA)A2抗原以来,各国科学家多年来通过协作和技术创新,极大推动了HLA领域的发展和应用,在HLA结构、功能、多态性、组织器官移植应用、人类群体遗传和进化分析等方面取得了重大成就。目前HLA分型技术已广泛应用于多个领域,如造血干细胞捐献者建库、HLA群体遗传多态性、HLA生物学功能、实体器官和造血干细胞移植供受者组织相容性配型、与某些疾病的关联、人类遗传进化、药物个性化选择等方面。HLA系统具有高度遗传多态性,现发现

2、的HLA抗原共有165个,其中HLA-A位点有28个、HLA-B位点有62个、HLA-C位点有10个、HLA-DR位点有24个、HLA-DQ位点有9个、HLA-Dw位点有26个、HLA-DP位点有6个。根据IMGT/HLA数据库3.23版本(2016年1月19日发布),总共发现14232个HLA等位基因,其中HLA-A位点为3356个、HLA-B位点为4179个、HLA-C位点为2902个、HLA-DRB1位点为1860个、HLA-DQB1位点为900个。一、HLA常见及确认等位基因表的提出HLA基因分型技术已得到广泛的应用,主要方法有PCR-SSP、P

3、CR-SSO、Luminex技术、PCR-SBT等。由于HLA基因高度多态性和检测技术的限制,在检测特定座位的分型中存在模棱两可的等位基因分型结果。模棱两可的基因型结果是指在HLA基因分型过程中,标本指定结果中存在一种以上的HLA等位基因组合方式。1、HLA分型检测存在模棱两可的等位基因分型结果随着HLA等位基因数量的增加,等位基因间碱基序列高度同源性也越来越高,同一位点不同等位基因之间碱基差异序列越来越少,造成检测区分难度相对增加;此外在测序过程中存在多种等位基因组合在测序区域内具有相同的杂合序列,可导致HLA基因分型时出现模棱两可的基因型结果。2、常

4、见及确认等位基因表的提出HLA分型方法产生模棱两可结果后不能得到单一的HLA分型结果,为解决这些模棱两可的结果,国际上提出了多种方法,其中之一为常见及确认等位基因表原则。2007年美国组织相容和免疫遗传协会(ASHI)成立了一个特设委员会,提出常见及确认的等位基因表(Commonallelesandwelldocumentedalleles,CWD)。CWD原则分型中将常见等位基因和确认等位基因合并为CWD,当模棱两可的等位基因组合中出现CWD等位基因需要进一步区分,而出现罕见等位基因组合其临床分型中实际意义有限可予以排除,此表给临床HLA高分辨分型检测

5、及实验室评估提供了参考依据。3、国际CWD表指导HLA高分辨分型和高分辨分型实验室的评估3.1美国ASHI/NMDP对HLA高分辨分型实验室的要求⑴如果实验室所报的结果以单一等位基因或者等位基因组(P组和G组)的分辨率为主,实验室将被授予HLA高分辨分型实验室资格。⑵质控盲样分型结果必须至少有80%为高分辨率分型结果。⑶为获得高分辨分型实验室的认证,高分辨分型实验室必须在前三个连续的质控调查中高分辨分型结果至少要达到80%。3.2高分辨分型的定义和要求⑴高分辨分型必须是单一等位基因型的结果。⑵除特定的不表达等位基因外,实验室并不需要区分如下不同等位基因之

6、间的差异。①在HLA-Ⅰ类基因中,等位基因的第2和第3外显子编码的氨基酸序列相同,而它们的差异仅在于第2和第3外显子之外的碱基序列;②在HLA-Ⅱ类基因中,等位基因的第2外显子编码的氨基酸序列相同,而它们的差异仅在于第2外显子之外的碱基序列;③这些信息应在目前的IMGT/HLA数据库和CWD表格中可查找到。④HLA-Ⅰ类基因的第2和3外显子,HLA-Ⅱ类基因的第2外显子编码相应HLA分子的抗原识别部位(ARS),所以在表述中也可以用ARS来替代HLA-Ⅰ类基因的第2和3外显子,HLA-Ⅱ类基因的第2外显子。⑶高分辨分型实验室需要区分那些特定的或者“经常发

7、现”的不表达等位基因。这些不表达等位基因可在CWD表查找(见下表)。它们的频率大于0.001,并与某些等位基因或某些单体型关联。⑷在临床实践中实验室可以利用一种以上的方法作为补充方法,例如利用血清学分型或序列分析等实验室的手段,来鉴定这些“经常发现”的不表达等位基因。表1需要鉴定和区分的不表达等位基因情况不表达等位基因二选一的常见等位基因单体型中相关联的等位基因多态性所处位置NullAlleleAlternativeCommonAssociatedAllelesLocationofAlleleinHaplotypePolymorphismA*24:09N

8、A*24:02:01:01B*40orB*27Exon4B*51:11NB*51

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