基因组学卷子

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1、基因组学卷子一、名词解释1、C值悖理(C-valueparadox):物种的C值和它的进化复杂性之间无严格对应关系,即生物的复杂性与基因组的大小并不完全成比例增加,这种现象叫C值悖理。2、反义基因:由靶基因的负链编码的可以干扰靶基因mRNA转录与翻译的基因。3、转化:是指受体细胞从环境中摄取供体细胞释放的DNA片段的过程。4、核酸杂交:是指两个互补或部分互补的核酸分子形成稳定的碱基配对杂交体的过程。5、密码偏倚:指特定生物的基因中并非平均地使用每个碱基密码子。6、开放阅读框:编码蛋白的基因中翻译成蛋白质的那部分序列。7、鸟枪法:将整个基因组打乱,切成随机碎片,然后测定每个小片段序列,直接从已

2、测序的小片段中寻找彼此重叠的测序克隆,最终利用计算机对这些切片进行排序和组装,并确定它们在基因组中的正确位置。8、直向同源:指同源基因来源于不同种属生物之间,它们的共同祖先早于种属分化。9、连接酶:通过在两个不同分子的末端核苷酸之间或同一分子的两端核苷酸之间生成磷酸二酯键把DNA分子连在一起的酶。10、共生同源:指同源基因来源于同种生物之间,常常是基因家族的成员,它们的共同祖先可能早于或晚于种属分化。11、基因内基因:是指一个基因位于另一个基因的内含子之间,在核基因组中相对常见。12、基因组:是指细胞中所有的DNA,包括所有的基因和基因间区域。13、基因:由不同的DNA片段组成的一个完整的表

3、达单位,有一个特定的表达产物,它们可以是RNA分子,亦可为多肽分子或者DNA分子中含有特定遗传信息(具有特定功能)的一段核苷酸序列,是遗传物质的最小功能单位。14、拟基因:是某一基因的非功能性拷贝,通常是因为发生了突变,其生物信息变得不可解读。15:、假基因:来源于功能基因但已失去活性的DNA顺序16、重复假基因:串接排列,具有祖先基因的组成特点,具内含子和外显子,突变失活。加工假基因:由RNA反转录成cDNA,再插入基因组中的基因顺序,无内含子,分散在基因组中,多5’残缺。残缺假基因:因不等交换使部分顺序缺失。17、同源性检索:将一段DNA或氨基酸序列提交到数据库进行序列比对查询,以判断所

4、查序列是否与已知基因的序列相同或相似。18、重叠群(contig):指相互间存在重叠顺序的一组克隆。克隆重叠群法:先将染色体打成比较大的片段(几十-几百Kb),利用分子标记将这些大片段排成重叠的克隆群(Contig),分别测序,然后根据重叠顺序的相对位置将各个克隆首尾连接。19、遗传作图(Geneticmapping):又称染色体图(chromosomemap)或基因连锁图(linkagemap),依据基因之间的交换值,确定连锁基因在染色体上的相对位置,从而绘制的一种简单线性示意图。这一方法包括杂交实验,家系分析。20、物理作图(Physicalmapping):采用分子生物学技术直接将DN

5、A分子标记、基因或克隆标定在基因组的实际位置。21、小卫星序列(minisatellite):又叫可变串联重复(variablenumberoftandemrepeats,VNTR),重复单位较长,一般为11-60bp,主要存在于染色体靠近端粒处,由于其拷贝数变化,在不同个体间中存在串联数目的差异,若在重复序列两侧有限制性内切酶酶切位点,则切下来的片段会呈现出多态性。22、微卫星序列(micrisatellite):又称简单串联重复(simpletandemrepeats,STR),或简单重复序列(simplesequencerepeats,SSR),重复单位较短,一般1-6个bp,由于重复

6、单位重复数目的变化而在群体中呈现出遗传多态性,散布于整个基因组中。23、单核苷酸多态性:是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的一种DNA序列多态性。24、转导(transduction):借助噬菌体来实现DNA从供体细胞转移到受体细胞。转化(transformation):供体细胞释放的一段DNA,经受体细胞摄取后整合到基因组中,一般借助抗性培养基筛选重组克隆。接合(conjugation):是一个供体(donor)即雄性细胞与另一个受体(recipient)即雌性细胞直接接触,而使DNA直接从供体细胞转移至受体细胞的过程。25、限制性作图:就是将限制性内切酶酶切位点标定在DNA分子的

7、相对位置。26、稀有切点限制酶:指该酶识别的碱基顺序在基因组中只有很少数量,可产生较大的DNA片段。27、指纹:指克隆的DNA序列所具有的特定的DNA片段组成一个克隆的指纹表示了该克隆所具有的限定的顺序特征,可以同其他克隆产生的指纹进行比较.28、荧光标记原位杂交:将探针用荧光标记,与细胞分裂中期的染色体杂交,用荧光显微镜观察信号所处的位置。29、基因文库:从生物体中制备基因组DNA,并用限制性内切酶切割产生

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