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1、第28卷第3期生物学杂志Vo.l28No.362011年6月JOURNALOFBIOLOGYJun,2011doi10.3969/jissn2095-1736.2011030842DDIGE技术在蛋白质组学中的应用121杜俊变,王丽惠,段江燕(1.山西师范大学生命科学学院,山西临汾041000;2.海南大学材料与化工学院生物工程系,海口570228)摘要:双向荧光差异凝胶电泳(2DDIGE)作为一种新型的蛋白质组分析技术,已经被广泛应用于动物、植物、微生物以及人类差异蛋白的研究。在动物医学方面,采用
2、DIGE技术,通过对不同类型,不同个体的细胞、组织、或经过不同处理和不同生长条件下蛋白质表达差异分析,在研究疾病的分子机理、分子诊断、药物作用机理、毒理学等方面都有广泛的应用。在植物学方面,该技术可以用来分离和分析植物亚细胞结构蛋白质组以及在生物和非生物胁迫下,植物细胞中蛋白质表达的差异性,从而建立差异蛋白相互作用网络图,从而为研究伤害机制提供一定的依据。关键词:2DDIGE;蛋白质组中图分类号:Q51文献标识码:B文章编号:2095-1736(2011)03-0084-042DDIGEinproteomicsa
3、pplications121DUJunbian,WANGLihui,DUANJiangyan(1.SchoolofLifeScience,ShanXiNormalUniversity,Linfen041000;2DepartmentofMaterialsandChemicalEngineering,HainanUniversity,Haikou570288,China)Abstract:Twowayfluorescencedifferencegelelectrophoresis(2DDIGE)asoneo
4、fnewanalyticaltechniqueswaswidelyusedinstudyofanimals,plants,microbesandproteinsofhumandifferences.Inanimalmedicine,usingDIGEtechnology,throughdifferenttypesofcellsindifferentindividuals,organizations,orthroughdifferenttreatmentsanddifferentproteinexpressionund
5、erdifferentgrowthconditionsanalyzedinthestudyofmolecularmechanismsofdisease,moleculardiagnostics,drugmechanism,drugsciencehasawiderangeofapplicationareas.Inbotany,thetechnologycanbeusedtoisolateandanalyzethesubcellularstructuresofplantproteinsaswellasinbiotica
6、ndabioticstress,plantcellsdifferencesinproteinexpressioninordertoestablishdifferencesinproteininteractionnetworkgraph,andthustostudythedamagemechanismtoprovidesomebasis.Keywords:2DDIGE;proteomics从生物体的不同器官,组织,细胞以及亚细胞结构这一方法应用到蛋白质组学研究领域,在双向凝胶电中将成千上万种蛋白质进行提取和分离是蛋
7、白质组学泳的基础上又形成了一项新技术差异凝胶电泳研究的前提工作。其中,双向电泳由于可以相对简(Differencegelelectrophoresis,DIGE),即将样品在双便,高通量地分离蛋白质,目前仍然是蛋白质组学研向电泳之前分别用不同荧光(如Cy2,Cy3,Cy5)标记,究中复杂蛋白质混合物分离中应用最广泛的技术。尽然后将标记后的3种样品混合,同时在一块胶上进行管随着双向电泳技术的不断改进,比较双向电泳图谱电泳,所得到的2D胶图像可使用3种不同的激发/发仍不失为一种有效的方法,但是传统的电泳图谱之间射过
8、滤器得到不同颜色荧光信号,根据这些信号的比的比较有其无法克服的局限性,即不同的图谱之间的例来判断样品之间蛋白质的差异。用于标记的荧光基[1]差异无法消除。1997年,UnluM等将荧光染料标记团在化学结构上相似,分子量也基本相同,都带有正电荷,所以在与赖氨酸残基反应时,保证了所有样品可以移至相同的位置。在2DDIGE技术中,每个蛋白点都收稿日
