α毒素诱导家蚕的基因表达模式及调控网络研究

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1、单位代码：１０６３５学号：１１２０１５４０８００２２９６Ｗ在凑硕士学位论文ａ毒素诱导家蚕的基因表达模式及调控网络研宄论文作者：冯铁山指导教师：程廷才副教授学科专业：生物化学与分子生物学研宄方向：生物信息学提交论文日期：２０１８年５月２２日论文答辩日期：２０］８年５月３１日学位授予单位：西南大学中国？重庆２０１８年０５月西南大学二零一八届硕士学位论文ａ毒素诱导家蚕的基因表达模式及调控网络研究学科专业生物化学与分子生物学研宄方向生物信息学指导教师程廷才副教授研究生冯铁山中国？重

2、庆２０１８年５月ＳｔｕｄｏｎＧｅｎｅＥｘｐｒｅｓｓｉｎＰａｔｔｅｒｎａｎｄｙＮｅｔｗｏｒｋｏｆ－－ｉｎＲｅｇｕｌａｔｏｒｙａｔｏｘｉｎｄｕｃｅｄＢｏｍｂｙｘｍｏｒｉＭａｏｒＢｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒａｎｄＭｏｌｅｃｕｌａｒＭｉｏｌｏｇｙｊｙＦｉｅｌｄＢｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓＡｄｖｉｓｏｒＡｓｓｏｃｉａｔｅＰｒｏｆ．ＴｉｎｃａｉＣｈｅｎｇｇＣａｎｄｉｄａｔｅＴｉｅｓｈａｎＦｅｎｇＣｈｏｎｇｑｉｎｇＣｈｉｎａ，Ｍａｙ，２０１８独创性声明学位论文题目：ａ毒素诱导家蚕的基因表达模式和调

3、控网络研究本人提交的学位论文是在导师指导下进行的研宄工作及取得的研宄成果。论文中引用他人己经发表或出版过的研宄成果，文中己加了特别标注。对本研宂及学位论文撰写曾做出贡献的老师、朋友、同仁在文中作了明确说明并表示衷心感谢。学位论文作者：７妥每久４签字日期：年＜月３曰学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解西南大学有关保留，有权、使用学位论文的规定保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和磁盘，允许论文被査阅和借阅。本人授权西南大学研究生院（筹）可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫

4、描等复制手段保存、汇编学位论文。（保密的学位论文在解密后适用本授权书，本论文：４保密，□保密期限至年月止）。学位论文作者签名：７＾山导师签名：〔签字日期：＞ｉｆ年月３日签字日期年４月？日目录目录ｍｍＩＡＢＳＴＲＡＣＴＩｌｌ１规雜１１．１家蚕病原微生物及宿主免疫１１丄１常见的家蚕病原微生物１１丄２黑胸败血芽胞杆菌及其研究进展１１丄３细菌感染宿主模式２１１４４．．昆虫的宿主免疫反应１．１．５与免疫相关的昆虫器官４１．２转录组测序５１．２．１转录组测序介绍５１．２．２

5、链特异性ＲＮＡ测序技术５１．３转录组测序的应用６１．３．１转录组测序用于研究基因表达量６１．３．２转录组测序用于研究长链非编码ＲＮＡ７１．３．３转录组测序用于研究调控网络８２１１弓｜胃２．１研究背景与目的意义１１２．２主要研究内容１１２．３研究技术路线１２３家蚕ＤＺ品种毒素处理及转录组测序１３３．１实验材料与方法１３３．１．１实验材料１３３丄２主要仪器１３３丄３相关软件与版本１３３丄４１３毒素处理与材料收集３丄５文库构建以及测序１４３．１．６转录组数据预处理１４３

6、丄７基于基因组的序列比对１４３．１．８转录本完整性评估１４３．２实验结果１５３．２．１数据质量符合后续分析要求１５ｉ西南大学硕士毕业论文３．２．２数据的特征１６３．３小结与讨论１７４ＣＸ毒素诱导家蚕的全基因组免疫应答１９４．１实验材料和方法１９４．１．１数据１９４１．２相关软件和版本１９４丄３比对到参考基因组１９４．１．４多比对位点的重新分配１９４１．５基因表达量的计算与转换２０４．１．６基因表达量的主成分分析２０４．１．７鉴定差异表达的基因２０４．１．８差异基

7、因的荧光定量ＰＣＲ验证２０４１．９基因表达量聚类２２４．２实验结果２２４．２．１比对情况统计２２４．２．２基因数字表达谱２３４．２．３差异基因的鉴定结果以及组织分布２５４．２．４差异基因的表达模式聚类结果２８４－．２．５差异基因的荧光定量ｑＲＴＰＣＲ验证２９４．２．６差异基因的功能富集２９４．３小结与讨论３１５长链非编码ＲＮＡ分析３３５．１实验材料和方法３３５丄１数据３３５丄２相关软件和版本３３５丄３比对到参考数据集３３５丄４ＩｎｃＲＮＡｓ表达量的计算与转换