浙大生物统计实验报告1

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1、课程名称：生物统计与实验设计姓名：赵应学院：农业与生物技术学院系：应用生物科学专业：应用生物科学学号：3140100080指导教师：朱军、徐海明2016年4月11日专业：应用生物科学姓名：赵应学号：3140100080日期：2016年4月11日地点：紫金港西1-106（多）装订线实验报告课程名称：生物统计与实验设计指导老师：徐海明成绩：________________实验名称：简单统计分析和简单线性回归实验类型：综合实验同组学生姓名：无一、实验目的和要求初步了解Excel软件的数据分析功能，掌握连续变量和离散变量的样本资料简单统计分析的方法，掌握简单回

2、归模型的分析方法。二、实验内容和原理1、连续变量的统计分析方法；2、离散变量的分析方法；3、简单回归模型的统计分析方法。三、主要仪器设备一台装有excel和SAS软件的PC四、操作方法和实验步骤1、实验数据的生成：本实验所用的数据需要基于设置的参数，运行计算机模拟软件(QTLSimulation.exe)产生。先打开参数设置文件SimPar.txt，用自己的学号替换第一设置行“Theseedforinitilizingtherand()=2551949”中的随机数发生器的种子“2551949”。然后重新保存设置文件。运行模拟软件时需要输入参数设置文件名

3、。模拟软件产生三个文件，DHSim.Par是基因数目、位置、效应的参数文件，DHSim.Map是分子标记遗传图谱的文件，DHSim.Txt是基因定位遗传群体（样本数n=200）的分子标记和二个环境模拟性状的表现型值的文件。以DHSimuData.xls文件的格式，整理可分析的数据文件。计算机模拟的参数设置如下：表1参数设置QTLChromosomeMarkerIntervalDistance(cM)AAE1AE21133.04.704.47-4.472178.00.000.000.003245.0-4.100.000.004362.00.000.000

4、.005331.03.50-3.163.16表2参数设置InteractionQTL-iQTL-jAAAAE1AAE21123.200.000.002130.00-4.204.20324-3.003.16-3.162、实验数据的分析：采用Excel软件整理数据，采用Excel对样本资料进行简单的统计分析和简单回归分析，如下：a)连续变量的统计分析：采用Excel分别计算仿真群体的表现型数据的样本均值、样本方差、标准误。a)离散变量的统计分析：对各分子标记位点，采用Excel计算仿真群体的分子标记基因型频率、样本频率的方差、标准误。b)简单回归模型的统计

5、分析方法;采用Excel以环境一的数据为依变量，以环境二的数据为自变量，计算简单线性回归系数的估计值及其标准误、计算各项变异的自由度、平方和、均方。采用Excel分别以二个环境的表现型数据为依变量，分子标记为自变量，计算仿真群体表现型数据与分子标记的简单相关系数。一、实验数据记录和处理表3连续变量的统计分析表现型方差表现型标准差表现型标准误环境1173.143597713.158404070.930439675环境294.651161719.728882860.687935904均值95%下限均值95%上限方差95%下限方差95%上限环境1102.22

6、43844105.8939576143.58902212.91719环境296.8322499.5454078.49477116.39390表4离散变量的统计分析均值方差标准误A的频率0.4939390.000340.003211B的频率0.5060610.000340.003211以环境一的表现型值为依变量，以环境二的表现型值为自变量，运行sas程序，得到：表5仿真群体表现型数据与分子标记的简单相关系数Mk1Mk2Mk3Mk4Mk5Mk6Mk7Mk8Mk9环境1-0.40929-0.51972-0.67318-0.616-0.53924-0.4071

7、4-0.35012-0.29228-0.27644环境2-0.06068-0.0452-0.015160.0764560.1130360.0799870.0450660.045995-0.02191Mk10Mk11Mk12Mk13Mk14Mk15Mk16Mk17Mk18环境1-0.19791-0.200390.1902740.194260.2731340.3249830.2727910.2170110.188191环境2-0.05579-0.075730.2174890.2539640.2903370.3997820.3680530.2570150.2

8、38907Mk19Mk20Mk21Mk22Mk23Mk24Mk25Mk26Mk17环境10.1