基于高通量测序的健康与子宫内膜炎奶牛阴道菌群差异性研究

《基于高通量测序的健康与子宫内膜炎奶牛阴道菌群差异性研究》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、分类号：单位代码：10193密级：学号：硕士学位论文基于高通量测序的健康与子宫内膜炎奶牛阴道菌群差异性研究DiversityanalysisofVaginalBacterialMicrobiotainHealthyandEndometritisDairyCowsthroughHigh-Throughputsequencing作者姓名：刘勋学位类别：农学硕士专业名称：临床兽医学研究方向：动物繁殖性障碍疾病指导教师：吕文发教授所在学院：动物科学技术学院2015年5月独创性声明本人郑重声明：所呈交的学位论文是本人在导

2、师指导下，独立进行研究所取得的成果。尽我所知，除文中特别加以标注和致谢所列内容外，论文中不包含其他个人或集体已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得吉林农业大学或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。本学位论文所有内容若有不实之处，本人愿意承担一切相关法律责任和后果。学位论文作者签名：签字日期：年月日关于学位论文使用授权的声明1.本人完全了解吉林农业大学有关保留和使用学位论文的规定，即：研究生在校攻读学位期间所完成的论文及相关成

3、果的知识产权属吉林农业大学所有，并同意将本论文的版权授权给吉林农业大学，学校有权保留送交论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。2、本人（同意/不同意，务必打印后填写）吉林农业大学将本论文版权授权给不同媒体进行电子出版、多媒体出版、网络出版以及其他形式出版（涉密学位论文解密后应遵守此协议）。3、本人声明毕业后若发表在攻读研究生学位期间完成的论文及相关的学术成果，必须以吉林农业大学作为第一署名单位。学位论文作者签名：签字日期：年月日指导教师签名：签字日期：年

4、月日摘要奶牛阴道菌群在维持其生殖道正常生理功能和预防疾病过程中起着非常重要的作用，阴道菌群的研究对诊治子宫内膜炎至关重要。目前，虽已有相关报道，但我们仍对阴道菌群的多样性和动态变化知之甚少。本试验为了深入研究奶牛阴道菌群的复杂变化和其与子宫内膜炎的关系，运用高通量测序对健康和子宫内膜炎奶牛产后不同时间段的阴道菌群进行比较研究。选取长春市地区的荷斯坦奶牛为实验动物，采集3头健康奶牛和3头患子宫内膜炎奶牛产后6-8d和34-36d的阴道黏液。通过提取样品中细菌总DNA、扩增细菌16SrDNAv3区片段、建立高通量测

5、序文库，然后对测序文库进行高通量测序，最后通过生物学分析比较健康与患子宫内膜炎奶牛产后不同时间段阴道菌群的结构差异。本试验通过对样品高通量(IlluminaMiSeq)测序，经过数据处理，最终得到710382条有效序列，再经生物信息学分析发现20个已知菌门的165已知菌属，还有一些未知菌类，每组样品在物种水平分类上的菌群数量、种类及丰度均存在差异。厚壁菌门(Firmicutes)为健康奶牛和患子宫内膜炎奶牛产后不同时间段阴道内共有的优势菌门，放线菌门(Actinobacteria)为产后34-36d的上述两种奶

6、牛阴道内的优势菌门，梭杆菌门(Fusobacteria)为产后6-8d患病奶牛阴道的优势菌门。在属的分类水平上我们发现健康奶牛和患病奶牛在产后34-36d阴道内共有优势菌属为梭菌属(Clostridium)，创伤球菌属(Helcococcus)和梭杆菌属(Fusobacterium)为产后6-8d患病奶牛阴道内优势菌属，健康奶牛产后6-8d并没有发现优势菌属。本试验经研究表明奶牛阴道菌群的构建是一个动态演变的过程，产后不同阶段健康奶牛和患子宫内膜炎奶牛阴道菌群的复杂度随产后时间的延长不断增加，并发现是在产后34

7、-36d健康奶牛阴道内的菌群数量和种类均为最多。总体上看，本试验证明了奶牛阴道内有其独特的菌群结构，发现健康奶牛和患子宫内膜炎奶牛的阴道内细菌群落构的差异性，并随时间呈动态变化。关键词：子宫内膜炎，阴道，菌群，高通量IAbstractCowvaginafloraplaysaveryimportantroleinmaintainingnormalphysiologicalfunctionofthereproductivetractandpreventingofdisease.Atpresent,althought

8、herearenumerousresearchreportsofcowvaginalflora,butwestillknowlittleofthediversityanddynamicchangesofvaginalflora.Thisexperimentisinordertofurtherstudythecowvaginalfloraandcomplexchanges,carried