水稻粒型和粒重性状主效qtl定位地研究

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1、厦门大学硕士论文摘要水稻特殊种质资源是解析水稻基因组功能的重要途径。水稻粒型(粒长、粒宽和长宽比)和千粒重性状与稻米外观、产量及市场价值密切相关，发掘控制水稻粒型和千粒重的主效基因是当前遗传学家和育种家们共同关注的焦点。本研究采用大粒种(JFl71和JFl78)和小粒种(JF222和Samba)做亲本，构建两个F。群体——JFl7l／Samba群体和JF222／JFl78群体；应用微卫星标记(simplesequencerepeats，SSR)，通过基于目标性状表现型的分离群体分组分析法(bulk

2、sergeantanalysis，BSA)构建遗传框架图；采用混合线形模型复合区间定位法(mixed—modeIbasedcompositeintervalmapping，MICM)对控制水稻谷粒粒型(粒长、粒宽和长宽比)和千粒重的主效基因进行QTL定位分析，并估算其效应值。本研究主要结果如下：(1)JFl71／Samba和JF222／JFl78两个群体谷粒粒型和千粒重性状间的相关性分析结果表明：粒长与粒宽、长宽比、千粒重均呈极显著正相关；粒宽与长宽比呈极显著负相关；长宽比与千粒重呈极显著正相关。

3、(2)应用SSR标记和BSA法构建两个群体的局部遗传连锁图，JFl71／Samba群体构建了4个连锁群，分布于1、2、6和8号染色体；JF222／JFl78群体构建了5个连锁群，分布于2、5、6、8和10号染色体。(3)两群体均在2号染色体长臂中下部一个相对较小的区间RM263一RM318检测到控制谷粒粒型(粒长、粒宽和长宽比)和千粒重性状的主效QTL，以加性效应为主，加性效应贡献率在18％-'-'60％，图谱距离约为18cM，它们的位置部分极为相近或在同一位点。JFl7l／Samba群体在2号染

4、色体定位到的主效QTL：口化名一』(粒长QTL)位于标记区间RM221-RM573，加性效应贡献率22．47％；9舭J(粒宽QTL)和口昭肛乒』(千粒重QTL)位于标记区间RM318一RM525，加性效应贡献率分别为40．02％和23．62％。JF222／JFl78群体在2号染色体定位到的主效QTL：q6L誓玖粒长QTL)和qGS-2-2(长宽比QTL)位于标记区间RMl3838一RMl3840，加性效应贡献率分别为60．46％和17．94％；口钟誓誓(粒宽QTL)和郦脚誓(千粒重QTL)位于标记

5、区间RM263-RMl3838，加性效应贡献率分别为31．49％和59．66％。同时两个群体都检测到微效QTL，分布于5、8和lO号染色体。(4)分析表明：本研究在2号染色体长臂P瑚263一RM318区间定位到控制水稻厦门人学硕十论文谷粒粒型和千粒重性状的QTL，是一个尚未被精细定位和克隆的粒型和千粒重性状的主效QTL。这为今后应用分子标记辅助选择大粒优质新品种和图位克隆提供了科学理论依据。关键词：水稻：粒型；粒重：数量性状基因座；基因定位II厦门大学硕士论文AbstractStudyingspe

6、cialgermplasmresourceisartimportantwaytorevealricegenomiefunction．Grainshapetraitsincludinggrainlength(GL)，grainwidth(GW)aswellaslength／widthratio(GS)and1000一grainweight(KGW)arecloselyassociatedwithriceappearancequality,yieldandmarketvalue．Inthisstudy

7、,weselectedlargegrainparent(JFl71andJFl78)andsmallgrainparent(JF222andSamba)toestablishtwoF2populations(JF17l／SambapopulationandJF222／JF178population)，andgeneticlinkagemapswereconstructedbasedonSSR(simplesequencerepeats)markerandBSA(bulksergeantanalys

8、is)method．TheQTLmappinganalysisofrelatedtraitswasconductedbyMICM(mixed—modelbasedcompositeintervalmapping)methodinthetwoF2populations．Mainresultsshowedasfollows：(1)CorrelationanalysisinbothF2populationsindicatedthatGLwasahighlysignificantlypos