《高级生物化学试题》doc版

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1、1为什么说蛋白质的一级结构决定其高级结构?一级结构也就是氨基酸序列,像是一些碱性氨基酸或是带电荷氨基酸会对蛋白质的2级结构产生决定性的作用,由于组成蛋白质的20种氨基酸各具特殊的侧链,侧链基团的理化性质和空间排布各不相同,当它们按照不同的序列关系组合时,就可形成多种多样的空间结构

2、和不同生物学活性的蛋白质分子。比如脯氨酸经常出现在肽链的折叠处;基酸的性质决定了他们的疏水或亲水,这样折叠时亲水的基团在外,疏水的在内。样下来组成蛋白一级结构的氨基酸间形成像氢键、二硫键这样的次级键,导致了蛋白2级结构的形成,如a折叠、b片层等。三级结构又是由2级结构所决定的,多个2级结构形成结构域,而4级结构又是由几个3级结构组成的,所以说蛋白质的一级结构决定了高级结构。2试论述蛋白质二级结构的三种基本类型的特点有哪些?α-螺旋蛋白质中常见的一种二级结构,肽链主链绕假想的中心轴盘绕成螺旋状,一般都是右手螺旋结构,螺旋是靠链内氢

3、键维持的。每个氨基酸残基(第n个)的羰基氧与多肽链C端方向的第4个残基(第n+4个)的酰胺氮形成氢键。在典型的右手α-螺旋结构中,螺距为0.54nm,每一圈含有3.6个氨基酸残基,每个残基沿着螺旋的长轴上升0.15nm。螺旋的半径为0.23nm。特点①肽链以螺旋状盘卷前进,每圈螺旋由3.6个氨基酸构成,螺圈间距(螺距)为5.44埃;②螺旋结构被规则排布的氢键所稳定,氢键排布的方式是:每个氨基酸残基的N—H与其氨基侧相间三个氨基酸残基的C=O形成氢键。这样构成的由一个氢键闭合的环,包含13个原子。因此,α-螺旋常被准确地表示为3.

4、613螺旋。螺旋的盘绕方式一般有右手旋转和左手旋转,在蛋白质分子中实际存在的是右手螺旋。β-折叠在β折叠中,两条以上氨基酸链(肽链),或同一条肽链之间的不同部分形成平行或反平行排列,成为“股”。肽平面之间呈手风琴状折叠,股与股之间会通过氢键固定,但氢键主要在股间而不是股内。氨基酸残基的R侧链分布在片层的上下。β折叠层并不是平的,因为侧链的存在使得它看上去像手风琴一样波纹起伏。这样每一股会更紧密排列,氢键更容易建立。氢键的距离为7埃。在蛋白质结构中β折叠通常会用箭头表示。肽链的氮端在同侧为顺式,两残基间距为0.65nm;不在同侧为

5、反式,两残基间距为0.70nm。反式较顺式平行折叠更加稳定。能形成β折叠的氨基酸残基一般不大,而且不带同种电荷,这样有利于多肽链的伸展,如甘氨酸、丙氨酸在β折叠中出现的几率最高。β-转角也是多肽链中常见的二级结构,连接蛋白质分子中的二级结构(α-螺旋和β-折叠),使肽链走向改变的一种非重复多肽区,一般含有2~16个氨基酸残基。含有5个氨基酸残基以上的转角又常称之环(loops)。常见的转角含有4个氨基酸残基,有两种类型。转角I的特点是:第1个氨基酸残基羰基氧与第4个残基的酰胺氮之间形成氢键;转角II的第3个残基往往是甘氨酸。这两

6、种转角中的第2个残基大都是脯氨酸。·由四个连续的氨基酸残基构成,主链骨架本身以大约180℃返回折迭。·第一个氨基酸残基的CO与第四个氨基酸的NH形成氢键,从而稳定转折的构象3如何将分子量相同的单链DNA与单链RNA分开,你能够设计出哪几种方法?分别叙述之。DNA,RNA不同:1.两性解离:DNA无,只有酸解离(○P),碱基被屏蔽(在分子内部形成了H键)。RNA有,有PI。2.粘度大:DNA>RNA,粘度由分子长度/直径决定,DNA为线状分子,RNA为线团。3.碱的作用:DNA耐碱RNA易被碱水解。4.显色反应:鉴别DNA和RNA

7、浓HCl浓HClRNA------→绿色化合物DNA------→蓝紫色化合物苔黑酚二苯胺啡啶溴红(荧光染料)和溴嘧啶都可对DNA染色,原理是卡在分子中,DNA的离心和电泳显色可用它们。5.溶解性:都溶于水而不溶于乙醇,因此,常用乙醇来沉淀溶液中的DNA和RNA。DNA溶于苯酚而RNA不溶,故可用苯酚来沉淀RNA。6.紫外吸收:核酸的λm=260nm,碱基展开程度越大,紫外吸收就越厉害。当A=1时,DNA:50ug/ml,RNA和单链DNA:40ug/ml,寡核苷酸:20ug/ml。用A260/A280还可来表示核酸的纯度:>1

8、.8,DNA很纯;>2RNA很纯。7.沉降速度:对于拓扑异构体(核苷酸数目相同的核酸),其沉降速度为:RNA>超螺旋DNA>解链环状DNA>松弛环状DNA>线形DNA也就是在离心管中最上层是线形DNA,最下面是RNA。8.电泳:核苷酸、核酸均可以进行电泳,泳动速

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