去势大鼠骨质疏松症基因表达谱特征初步研究

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1、去势大鼠骨质疏松症基因表达谱特征初步研究摘要:目的探讨去势大鼠骨质疏松症与正常大鼠基因表达谱的差异,初步分析去势大鼠骨质疏松症基因表达谱的特征。方法应用基因芯片技术检测去势大鼠骨质疏松症与正常大鼠相关基因的表达,通过GeneOntology(GO)数据库对差异表达基因进行基因信息学分析,运用AgilentGeneSpringGX11软件对差异基因进行GO分析。结果去势大鼠骨质疏松症共有118条基因发生了差异表达,其中有48条基因上调,70条基因下调。结论多种基因表达异常与去势大鼠骨质疏松症相关。关键词:去势大鼠;骨质疏松;基因表达谱D

2、0I:10.3969/j.issn.1005-5304.2012.12.011中图分类号:R446文献标识码:A文章编号:1005-5304(2012)12-0029-03PreliminaryAnalysisonGeneExpressionProfilesofOsteoporosisinOvariectomizedRatsGAOFengl,M0Xin-minl,LIJin-ping2,LIUShi-jiel,ZHANGXiao-junl(1.HunanUniversityofTCM,Changsha410007,China;2.Co

3、llegeofPharmacy,CentralSouthUniversity,Changsha410013,China)Abstract:ObjectiveToinvestigatethedifferenceofthegeneexpressionprofilebetweenosteoporosisofovariectomizedratsandnormalrats,andanalyzethecharactersofthegeneexpressionprofileoftheosteoporosisofovariectomizedrats.

4、MethodThegeneexpressiondifferencebetweenosteoporosisofovariectomizedratsandnormalratswastestedbyusingcDNAmicroarraytechnology.ThegeneinformationofthegeneexpressiondifferencewasanalyzedinGenethem,48geneswereupregulated,70weredownregulated・ConclusionManyabnormalgenesexpre

5、ssionrelatedwithosteoporosisinovariectomizedrats・Ontology(GO)database,analyzedbyGOanalysisGenespringGX11.ResultsdifferentiallyexpressedandthedifferentgeneswereusingthesoftwareAgilentAtotalof118significantgenesweredetected,amongKeywords:ovariectomizedrats;osteoporosis;ge

6、neexpressionprofiles骨质疏松症(osteoporosis,OP)是以骨量减少、骨的微观结构退化为特征,骨的脆性增加易于发生骨折的一种疾病。骨质疏松症的发生、发展是一个复杂过程,其演化过程涉及大量的基因突变、缺失、扩增及失活等异常表达信息,因此,发挥基因芯片技术多样本、高通量、高效率和平行监测识别功能,对阐明骨质疏松症的病因,揭示其发病机制以及开辟新的诊断途径和治疗方法有广阔前景。本研究利用大鼠全基因组微珠芯片初步探讨0P基因表达谱系的变化,并对差异表达基因进行生物信息学分析,以探讨原发性骨质疏松症的发生机制。1材料

7、与方法1.1动物采用3月龄SD雌性大鼠20只,体质量250g左右,SPF级。饲料为标准普通饲料,湖南中医药大学实验动物中心提供,许可证号:SCXK(湘)2009-0004o1.2试剂RatRef-12_Vl5590097019大鼠全基因组微珠芯片,美国Illumina公司制作;Cy3AmershampharmaliaEiotech;反转录酶(SuperscriptII),GibcoBRL;Oligo(dt)18,生研(上海)基金项目:国家自然科学基金(30873291)通讯作者:莫新民,Tel:0731-85539630,E-mail

8、:moxinmin52@hotmail.com生物科技有限公司;dNTP,PROMEGAo1.3主要仪器电动玻璃匀浆机,DY89-1,宁波新芝科器研究所;电泳仪FR-280,上海复日科技凝胶成像仪FR-200,上海复日科

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