vasp经典学习教程-有用

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1、VASP学习教程太原理工大学量子化学课题组2012/5/25太原13目录第一章Linux命令11.1常用命令11.1.1浏览目录11.1.2浏览文件11.1.3目录操作11.1.4文件操作11.1.5系统信息1第二章SSH软件使用22.1软件界面22.2SSHtransfer的应用32.2.1文件传输32.2.2简单应用3第三章VASP的四个输入文件33.1INCAR33.2KPOINTS43.3POSCAR43.4POTCAR5第四章实例54.1模型的构建54.2VASP计算84.2.1参数测试84.2.2晶胞优化(Cu)134.2.3Cu(100)表

2、面的能量24.2.4吸附分子CO、H、CHO的结构优化24.2.5CO吸附于Cu100表面H位44.2.6H吸附于Cu100表面H位54.2.7CHO吸附于Cu100表面B位64.2.8CO和H共吸附于Cu100表面74.2.9过渡态计算813第一章Linux命令1.1常用命令1.1.1浏览目录cd:进入某个目录。如：cd/home/songluzhi/vasp/CH4cd..上一层目录；cd/跟根目录；ls:显示目录下的文件。注：输入目录名时，可只输入前3个字母，按Tab键补全。1.1.2浏览文件cat：显示文件内容。如：catINCAR如果文件较大，

3、可用：catINCAR

4、more(可以按上下键查看)合并文件：catAB>C(A和B的内容合并，A在前，B在后)1.1.3目录操作mkdir：建立目录；rmdir：删除目录。如：mkdirT-CH3-Rh1111.1.4文件操作rm：删除文件；vi：编辑文件；cp：拷贝文件mv：移动文件；pwd：显示当前路径。如：rmINCARrma*(删除以a开头的所有文件)rm-rfabc(强制删除文件abc)tar：解压缩文件。压缩文件？？rar1.1.5系统信息df：分区占用大小。如：df-hdu：各级目录的大小。top：运行的任务。psax：查看详细任务。ki

5、ll：杀死任务。如：kill12058（杀死PID为12058的任务）注：PID为top命令的第一列数字。23第二章SSH软件使用2.1软件界面SSH界面SSHtransfer232.2SSHtransfer的应用2.2.1文件传输从本地文件中，把所需的计算文件直接拖到服务器中。一般就是VASP计算的四个文件INCAR，KPOINTS，POSCAR，POTCAR。2.2.2简单应用在右侧文件夹中可以直接构建文件夹，删除文件，修改文件。从SSH要cd到某个文件夹下时，可先从SSHtransfer进入，直接复制路径栏，可快速进入。第三章VASP的四个输入文件

6、3.1INCARSYSTEM=nameENCUT=400PREC=MediumEDIFF=5E-4EDIFFG=-0.1GGA=91VOSKWN=1!磁性计算ISYM=0!对称0无1有LREAL=.FALSE.!倒空间ISPIN=2!2磁性计算1不进行ISTART=0!0初次计算，1再次计算ICHARG=2!2构造原子密度ISMEAR=2!-5半导体；DOS静态计算0；原胞较大，k点小于4，单个原子，小分子；12金属体系。SIGMA=0.1IBRION=2!1DIIS,2CG,5频率，3过渡态ISIF=2!2结构优化，3晶胞优化NSW=200!离子运动步

7、数POTIM=0.05!步长NELMIN=4!最小迭代次数NELM=200!最多迭代次数LWAVE=.FALSE.!不输出波函数LCHARG=.FALSE.!不输出密度函数233.2KPOINTS对于表面surface0M551000对于分子和原子atomormolcular1Rec00013.3POSCARCH4在Co100表面Top位的吸附!(名称)1.05.01200008390.00000000000.00000000000.00000000005.01200008390.00000000000.00000000000.000000000015.

8、3159999847CoHC1641SDirect0.0000000000.0000000000.108070001TTT0.0000000000.0000000000.333149999TTT0.2500000000.2500000000.000000000FFF0.2500100140.2500000000.225119993TTT0.5000000000.0000000000.108060002TTT0.5000000000.0000000000.333149999TTT0.7500000000.2500000000.000000000FFF0.7

9、499899860.2500000000.225119993TTT0.00000