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《刚竹属几种重要散生竹lhca1基因的克隆及序列比较》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在工程资料-天天文库。
1、刚竹属3种重要散生竹光系统Ⅰ基因（Lhca1）的克隆、序列分析和蛋白结构预测唐文莉1彭镇华12高健1*(1国际竹藤网络中心国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室2中国林业科学研究院林业研究所)摘要：光系统Ⅰ在植物光合系统中具有重要功能，Lhca1是编码PSⅠ复合物中最主要的捕光色素蛋白LHCⅠ的基因。本研究采用RT-PCR法，从毛竹中克隆了捕光叶绿素a/b结合蛋白基因LhcaPe01的全长(GenBankEU035496)，从红壳竹和角竹中克隆了长度分别为616bp、613bp的捕光叶绿素a/b结
2、合蛋白基因片段LhcaH01(GenBankEU513200)、LhcaJ01(GenBankEU513201)。运用生物信息学方法对其核苷酸序列、编码的氨基酸序列以及蛋白结构进行预测。结果表明LhcaPe01基因序列从第39bp开始到第779bp含有1个开放阅读框（openreadingframe,ORF）和一个中止密码子，该基因全长1051bp，在5’端有38bp的非编码区（untranslatedregion,UTR），在3’端含有242bp的非编码区（untranslatedregion,
3、UTR）和Poly(A)30bp。对这3个基因的保守片段的序列分析表明，刚竹属三种竹种毛竹、红壳竹和角竹保守区内核酸序列同源性非常高，红壳竹与毛竹和角竹的同源性分别为98.1％和98.9％，而毛竹和角竹的同源性高达99.7％；在禾本科内不同属之间毛竹与大麦序列同源性最高，玉米次之，同源性分别为93%，91％；编码的氨基酸序列同源性与核酸序列同源性一致，最高是毛竹与大麦，水稻次之。经推测LhcaPe01编码的蛋白质等电点和分子量分别为5.4000和22107.34Da。蛋白质结构预测表明，毛竹、大麦
4、、水稻、玉米的LHCⅠ蛋白结构非常相似。这是我国首次报道的竹子光合系统Ⅰ的捕光叶绿素a/b结合蛋白基因的全序列。关键词：毛竹（Phyllostachysedulis）；红壳竹（Phyllostachysiridescens）；角竹（Phyllostachysfimbriligula）；Lhca1；克隆；序列分析；结构预测TANGWen-li1;PengZhenhua1,2;Gaojian1*.CloningandsequenceanalysisofLhca1genethelightharvesti
5、ngcomplexfromthreekindsofPhyllostachysandstructurepredictionoftheprotein.1．KeyLabratoryofBambooandRattanScience&TechnologyofStateForestryAdministration,InternationalCentreforBambooandRattan,Beijing,100102,P.R.China;2．ResearchInstituteofForestry,Chines
6、eAcademyofForestry,Beijing,100091,P.R.China.LightharvestingcomplexⅠ(LhcI),isachlorophylla/b-bindingprotein,whichplaysakeyroleinplantphotosynthesis.Afull-lengthcDNAencodingLhca1genewasclonedfromthefirststrandofPhyllostachyseduliscDNAthroughRT-PCRmethod
7、,namedasLhcaPe01(GenBankEU035496).616bpcDNAfragmentwasclonedfromthefirststrandofP.iridescenscDNA,namedasLhcaH01(GenBankEU513200)and613bpcDNAfragmentwasclonedfromthefirststrandofP.fimbriligulacDNA,namedasLhcaJ01(GenBankEU513201).ThelengthofLhcaPe01is10
8、51bp，whichcontainsanopenreadingframeencoding249aminoacidsfrom39to779positionsandhas38bpand242bpuntranslatedregionsof5’endand3’end,respectively.Thereisa30bpPoly(A)in3’end.TheP.iridescensPpIandMwofproteinencodedbyLhcaPe01werepredictedtobe5.4000a
