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时间:2021-04-15
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1、二pcr反应体系taqdna聚合酶-昆明医科大学第二节聚合酶链式反应polymerasechainreactionPCR教学内容和目的要求:*掌握PCR的原理*掌握PCR的反应体系和方法*熟悉PCR在法医学的应用*一.PCR原理(PCRprinciple)在体外,以一对人工合成的特异性寡核苷酸为引物,四种脱氧核苷酸为底物,以待测目的DNA为模板,在DNA聚合酶的催化作用下,通过高温变性、低温退火、中温延伸的温度循环,选择性扩增目的DNA片段,经过30个循环周期后,目的DNA片段达到百万倍的扩增。ThePCRpr
2、inciplePCRisjustlikeDNAreplicationinvivo.apairofoligonucleotides--primers(引物)dNTP--substrate(底物)TargetDNA--template(模板)TaqDNApolymerase--enzyme(酶)Denaturation(变性)---高温Annealing(复性)---低温Extension(延伸)---中温ThePCRprocedureTheReactionThermalCyclerPCRtubesDNADenat
3、uration(DNA变性)通过加热(94℃)使模板DNA双链间氢键断裂,双链解离形成两条单链DNA的过程。DNAAnnealing(DNA退火)又称DNA复性,将反应体系降温(60℃),引物与单链模板DNA按照碱基互补配对的原则重新形成模板-引物杂化双链的过程。DNAExtension(DNA延伸)DNA聚合酶在适当温度条件下(72℃)催化4中dNTP原料按照碱基互补配对原则从引物的3’末端开始渗入,延模板有5’3’方向延伸,合成一条新的DNA链的过程。DNAtemplate95℃Denaturation(
4、heatto95oC)95℃50-60℃AntisensePrimerSensePrimerAnnealwithprimers(lowerto50-60℃)PCR的基本原理PCR反应条件PCR过程PCR的特点50-60℃72℃Taq酶Taq酶Extension(increaseto70oC)AntisensePrimerSensePrimerPCR的基本原理PCR反应条件PCR过程PCR的特点72℃ThefirstcyclePCR的基本原理PCR反应条件PCR过程PCR的特点95℃65℃72℃TaqTaqTaq
5、TaqThesecondcyclePCR的基本原理PCR反应条件PCR过程PCR的特点DNAtemplate20-30cycles1234522557294时间(min)温度(℃)适温延伸3高温变性1低温退火2重复1~3步25~30轮目的DNA片段扩增100万倍以上DNA双螺旋DNA单链与引物复性DNA变性形成2条单链子链延伸DNA加倍预变性(93-95C,2-5m)变性(93-95C,30s)退火(50-70C,30s)延伸(75C,30-60s)总延伸(75C,7m)(25-35)PCR的一般过程
6、:经过30次的循环,扩增的DNA片段可达100万倍以上。*二.PCR反应体系TaqDNA聚合酶(TaqDNApolymerase)引物(primer)dNTP(A、T、C、G)模板(template)Mg2+(PCRbuffer)标准的PCR反应体系(100l)4种dNTP混合物各200mol/L(A、C、T、G)引物各10~100pmol(上游引物、下游引物)模板DNA0.1~2gTaqDNA聚合酶2.5u缓冲液Mg2+1.5mmol/LKCl50mmol/LTris-HCl(Ph8.4)10mmol/
7、L0.001%明胶或牛血清蛋白What’sintheTubeTargetDNA5’3’3’5’primersABdNTPTaqDNApolymeraseMg2+Mg2+Mg2+Mg2+Mg2+Mg2+Buffercontainingmagnesium1.TaqDNA聚合酶(TaqDNApolymerase)最适温度:72℃,半衰期:92.5℃130min;95℃40min;97.5℃5—6min。酶量增加使反应特异性下降;酶量过少影响反应产量。1.TaqDNA聚合酶(TaqDNApolymerase)水生栖热菌
8、(thermusaquaticus,Taq)的DNA聚合酶。①5’3’DNA聚合酶活性;②无3’5’外切酶活性,没有引物3’端错配碱基的校正功能,35轮循环有0.25%错配,与原始模板有差别。人工合成的寡核苷酸序列,与靶DNA片段两侧翼的序列互补。引物序列限定了PCR产物的长度和特异性。引物浓度一般为0.1~0.5mol/L。2.引物(primer)例如IL-3:5‘GCTCCA
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