蛋白质结构和功能----------氨基酸.doc

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1、Word文档...范文范例...内容齐全蛋白质结构与功能——氨基酸2010遗传学专业资料...供学习...参考...下载Word文档...范文范例...内容齐全Chapter1氨基酸I蛋白质的天然组成天然蛋白质几乎都是由18种普通的氨基酸组成：L-氨基酸，L-亚氨基酸(脯氨酸)和甘氨酸。一些稀有的氨基酸在少量的蛋白质中结合了L-硒代胱氨酸。II氨基酸的结果每种氨基酸（除了脯氨酸）：都有一个羧基，一个氨基，一个特异性的侧链（R基）连接在α碳原子上。在蛋白质中，这些羧基和氨基几乎全部都结合成肽键。在一般情况下，

2、除了氢键的构成以外，是不会发生化学反应的。氨基酸的侧链残基（R基）提供了多种多样的功能基团，这些基团赋予蛋白质分子独特的性质，导致：A.一种独特的折叠构象B.溶解性的差异C.聚集态D.和配基或其他大分子构成复合物的能力，酶活性等等。蛋白质的功能是与蛋白质氨基酸排列顺序和每个氨基酸残基的特征有关。那些残基赋予蛋白质独一无二的功能。氨基酸的分类是依照它的侧链性质的A．非极性侧链的氨基酸B．不带电的极性侧链氨基酸C．酸性侧链的氨基酸专业资料...供学习...参考...下载Word文档...范文范例...内容齐全A

3、．碱性侧链的氨基酸A.非极性侧链氨基酸非极性氨基酸在蛋白质中的位置：在可溶性蛋白质中，非极性氨基酸链趋向于集中在蛋白质内部。甘氨酸(GlyG)结构：最简单的氨基酸，在蛋白质氨基酸当中，是唯一缺乏非对称结构的氨基酸。特征：甘氨酸在蛋白质结构中起到一个很重要的作用，与其它氨基酸残基相比，由于缺少b-碳原子，它在蛋白质的构象上有很大的灵活性和更容易达到它的空间结构。功能和位置：1.甘氨酸经常位于紧密转角；和出现在大分子侧链产生空间位阻影响螺旋的紧密包装处（如胶原）和结合底物的地方。2.由于缺乏空间位阻侧链，所以甘

4、氨酸在邻近的肽键的位置有更强化学反应活性。例如：Asn-Gly3.甘氨酸也出现在酶催化蛋白质特异性修饰的识别位点，例如N端的十四酰基化（CH2(CH2)12CO－)和精氨酸甲基化的信号序列。丙氨酸(AlaA)结构：是20种氨基酸中最没有“个性”的氨基酸，没有长侧链，没有特别的构象性质，可以出现在蛋白质结构的任何部位。特征：1、丙氨酸是蛋白质中含量最丰富的氨基酸残基之一，弱疏水性。2、化学活性非常弱。缬氨酸(ValV)特征：中度疏水的脂肪族侧链残基。功能：3、这个中度疏水残基β碳原子上的甲基降低了蛋白质的构象

5、的灵活性。2、使邻近的肽键的化学反应产生空间位阻，特别是相邻残基具有β-分支的侧链（缬氨酸或异亮氨酸）。异亮氨酸（IleI）特征：疏水的脂肪族残基侧链功能：1.b-分支链在空间上阻碍邻近的肽键反应。2.疏水侧链趋向在折叠蛋白的内部，比起a螺旋这种侧链在二级结构中更容易形成b折叠。3.异亮氨酸有第二个不对称中心。亮氨酸（LeuL）结构：有一个大的疏水残基。专业资料...供学习...参考...下载Word文档...范文范例...内容齐全功能：1.这种氨基酸通常存在于球状蛋白中。在这类蛋白质中因有大的脂肪族残基侧

6、链而形成疏水中心2.是膜蛋白中跨膜螺旋的主要组成部分。3.形成有规则地“亮氨酸拉链”结构。苯丙氨酸（PheF）结构：拥有庞大的疏水侧链——苯环特征：弱的极性特性利于其与其它的芳香族和其它极性基团相互作用时优先定位功能：是球状蛋白疏水核心和膜蛋白跨膜区域的重要成分。甲硫氨酸（MetM）结构：两种含硫氨基酸中的一个（硫醚基）特征：1.大小和疏水性跟亮氨酸的相似。2.硫原子可以和金属离子相互作用发生化学反应，特别是跟氧化剂发生反应。3.硫醚基可以被烷基化，在酸性条件下也可以跟溴化氰发生反应。色氨酸（TrpW）结构

7、：一种带有吲哚NH基的氨基酸。特征：1.色氨酸残基经常在结构性包装作用中起关键作用。2.它的高度疏水性受到吲哚NH基的调节。3.色氨酸残基经常构成配体连接位点的一部分。4.色氨酸残基的吲哚环容易受到亲电攻击。5.蛋白质的光敏感性在很大程度上是因为色氨酸残基的氧化降解。6.色氨酸残基具有最大的紫外吸收和荧光特性。脯氨酸（ProP）结构：次级氨基酸，具有脯氨酰基特征：1.脯氨酸残基的构象灵活性受到限制，脯氨酸残基经常出现在紧密转角蛋白质表面。2.脯氨酸不可参加全部a螺旋的氢键的形成，它们在螺旋轴上形成一个扭曲。

8、3.在蛋白质结构中存在顺式的肽-脯氨酸结合物（除了最常见的反式形式）4.化学活性,1)脯氨酸残基是惰性的。2）脯氨酸残基是脯氨酸特异的多肽内切酶位点，多肽和蛋白质的脯氨酸依赖性已被提出。B．极性不带电侧链的氨基酸（这些氨基酸在中性的pH中不带电荷）丝氨酸（SerS）结构：带有初级脂肪族羟基的氨基酸特征：1.既是氢键的供体，也是氢键的受体。在折叠蛋白表面时常与溶剂水相互作用。2.氧原子是具有弱亲核性的，但是在很多种