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《进境旅客携带物中大豆黄化普通花叶病毒的检测-论文.pdf》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、第39卷第5期植物保护学报Vo1.39No.52012年1O月ACTAPHYTOPHYLACICAsINICAOct.2012进境旅客携带物中大豆黄化普通花叶病毒的检测DetectionandidentificationofSoybeanyellowcommonmosaicvirusfromtheimportedsoybeanseedswithinpassenger’Sbaggage吴东妮陈舜胜于子翔杨翠云朱雅君于翠(1.上海出入境检验检疫局,上海200135;2.上海海洋大学,上海201306)WuDongni-ChenShunshengY
2、uZixiangYangCuiyunZhuYajunYuCui(1.ShanghaiEntry—ExitInspectionandQuarantineBureau,Shanghai200135,China;2.ShanghaiOceanUniversity,Shanghai201306,China)大豆黄化普通花叶病毒(SoybeanyellowcommonGTGAGTAAGAGTCGTAT一3。RNA提取和RT—PCRmosaicvirus,SYCMV)是新近报道的南方菜豆花叶方法参考于翠等J。PCR扩增反应条件:94℃预变病毒属Sobom
3、ovirus的一个种⋯。SYCMV自然寄主性3min;94oC变性30S,55℃复性45S,72℃延伸45范围较窄,主要侵染大豆和中国野生大豆,引起叶片S,35个循环;72℃延伸7min。保存于25℃备用。黄化和花叶等症状,可通过种子以及叶甲等昆虫介1.3SYBRGreen实时荧光RT.PCR反应体传播,也可摩擦接种J。Nam等通过全基因SYBRGreen实时荧光RT—PCR反应条件:95。【=组序列测定、侵染性克隆构建及系统进化分析等确预变性15min;95oC10S,60℃30S,共40个循环。认SYCMV基因组为单分体正义RNA,共有约
4、4000最后增加熔解过程。个核苷酸,编码1个30kD的外壳蛋白。目前,仅有1.4检测方法灵敏度的比较SYCMV在韩国发生危害的报道,尚未见有关SYCMV提取带毒大豆总RNA,以焦碳酸二乙酯(dieth—检测方法的相关报道。SYCMV与我国进境检疫性有ylpyrocarbonate,DEPC)处理水做lO倍梯度稀释后害生物南方菜豆花叶病毒(Southernbeanmosaicvirus,分别反转录合成cDNA,用于比较RT—PCR和SYBRSBMV)全基因组序列的同源性达到72.9%,而sB.Green实时荧光RT.PCR的灵敏度。MV侵染豆科
5、植物后导致种子重量和数量显著下2结果与分析降,因此,对进境植物种苗中SYCMV的检测应予以2.1RT-PCR检测重视。本试验以截获旅客携带的大豆作为待测样从变色、皱缩的大豆样品中提取总RNA进行反品,根据已经公布的SYCMV的序列设计特异性引转录后,以SYCMV.199F/R特异性引物进行PCR扩物,建立针对SYCMV的RT.PCR和SYBR—Green实增。从该样品中扩增到了预期的199bp特异性条时荧光RT—PCR检测方法。带,而从健康和阴性对照中无扩增条带。将扩增条1材料与方法带测序后与GenBank数据库中已公布的SYCMV的1.1材
6、料CP基因组序列比对分析,其同源性为96.2%。从截获的大豆种子中挑选表皮变色或皱缩的种2.2SYBRGreen实时荧光RT—PCR检测子,用冷冻混合球磨仪研成粉末,用于检i贝4。以带毒大豆的cDNA为模板,用特异性引物1.2反转录聚合酶链式反应SYCMV一199F/R进行SYBRGreen实时荧光RT—根据GenBank已公布的SYCMVCP基因序列PCR扩增,可得到标准s型曲线和具有单一峰的熔设计特异性引物,条带大小为199bp。上游引物:5.解曲线,而健康对照没有荧光吸收值,这说明设计的CATAGCGAACACTITGGAAC-3,下游
7、引物:5一AGA.引物特异性较好。基金项目:国家质检总局科技项目(2011IK172)作者简介:吴东妮,女,1987年生,硕士研究生,研究方向为植物病毒检测,E—mail:wudongni0719@126.corn通讯作者(Au~orforcorrespondence),E—mail:yuc@shciq.gov.cn收稿日期:2012—05—17478植物保护学报39卷2.3灵敏度比较稀释至10时才无扩增,由此可见SYBR—Green实当模板RNA稀释至10时,RT—PCR还有隐约时荧光RT—PCR的灵敏度比RT—PCR高约100倍的条带,而
8、SYBR—Green实时荧光RT—PCR在RNA(图1)。Ml234567892000100075050025010O5l0l5202530354O循环数Cycle
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