植物酰基载体蛋白基因家族序列分析

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1、●CT●-BRICULTURgE华北农学报·2010，25(增刊)：1-6_●旺札l_S帅“植物酰基载体蛋白基因家族序列分析李孟军r，史占良，郭进考，何明琦，王彦霞2(1．石家庄市农林科学研究院，河北石家庄050041；2．河北省小麦工程技术研究中心，河北石家庄050041)摘要：以拟南芥酰基载体蛋白为查询序列，检索18个植物物种的基因组数据库，获得138个酰基载体蛋白基因和12个基因片段。植物酰基载体蛋白由1个基因家族编码，成员2—16个。植物酰基载体蛋白磷酸泛酰巯基乙胺结合位点(Set)周围的氨基酸序列高度保守，该位点包含在保守的DSL基序中。植物酰基载体蛋白基因结构类型分为5

2、种，其中类型IⅡ酰基载体蛋白基因所占比例最大。绝大多数植物酰基载体蛋白基因家族成员单独或2—4个成员分布在一条染色体上。在138个植物酰基载体蛋白基因中，19个具有不同剪接体。植物酰基载体蛋白基因家族成员可能起源于一个共同的祖先基因。关键词：酰基载体蛋白；基因家族；亚细胞定位；基因结构中图分类号：Q78文献标识码：A文章编号：1000—7091(2010)增刊一0001—06SequenceAnalysisofPlantAcylCarrierProteinLIMeng-jun’，SHIZhan．1iang，，GUOJin．kao，，HEMing．qi'，WANGYan—xia，(1

3、．ShijiazhuangAcademyofAgriculturalandForestrySciences，Shijiazhuang050041，China；2．WheatEngneeringResearchCenterofHebeiProvince，Shijiazhuang050041，China)Abstract：Blastingtargetgenomedatabaseof18plantspeciesusingeightA．thalianaacylcarrierproteins(ACPs)asqueries，138ACPcDNAsequencesand12ACPfragment

4、swereisolated．PlantACPswereencodedbyonegenefamilyincluding2—16members．Theaminoacidsequencesurroundingthephosphopantetheineattach-mentsites(Ser)withintheDSLmotifwashighlyconservedinplantACPs．GeneorganizationofplantACPscanbegroupedintofivetypesandthetypeII1wasinthelargestproportion．Oneor2—4membe

5、rsofACPfamilieswerelo—catedononechromosomeinmostplantgenomes．NineteenACPgenescanproducesplicingvariantsin138plantACPs．PlantACPisoformsmaybeoriginatedfromoneancestralACPgene．Keywords：Acylcartierprotein；Genefamily；Subcelluarlocation；Geneorganization酰基载体蛋白(Acylcarrierprotein，ACP)是一his)]、大麦．9]、白菜型

6、油菜(Brassicacampestis类具有保守丝氨酸残基的小分子量的酸性蛋白质。)∞】、甘蓝型油菜(B．napus)n引、披针叶萼距花在脂肪酸从头合成过程中，ACP携带酰基链完成缩(Cuphealanceolata)¨卜、拟南芥(Arabidopsisthali．合、还原和脱氢等酶促反应。同时，ACP还是硬脂ana)n和栽培花生(Arachishypogaea)加。。植物酰一ACP脱饱和酶(Stearoyl—ACPdesaturase)、脂ACP的表达方式包括组成型表达、组织特异性表达酰基一ACP脱氢酶(Acyl—ACPhydrolase)和脂酰基和细胞器特异表达3种类型·。J

7、JJ船-24]。转移酶(Acyltransferase)的辅助因子¨J，在不同长植物脂肪酸中不同种类脂肪酸的含量、组成以度酰基链的去饱和、脱氢和转移反应中发挥作用。及在总脂肪酸中所占比例，与ACP的种类及差异表在细菌和植物中，ACP属于1个由保守载体蛋达具有密切关系。同时，一些种类的ACP还具有特白组成的大家族。在细菌中，ACP由1个基因编殊的作用。在拟南芥叶中过量表达ACP1(在种子码H，而在植物中存在多个ACP基因，如菠菜(sp中表达占优势)改变了叶片的脂肪酸组成