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时间:2020-04-06
《建立和编辑保留时间锁定(RTL)扫描 定量数据库和谱库.pdf》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在教育资源-天天文库。
1、建立和编辑保留时间锁定(RTL)扫描/定量数据库和谱库技术综述作者软件要求MichaelJ.Szelewski,KennethR.Weiner,andChin-KaiMeng•GC/MSDrevisionD.01.01(D.01.00sp1)或更高版本AgilentTechnologies,Inc.•MicrosoftExcel2850CentervilleRoadWilmington,Delaware19808-1610USA文件定位(文件类型:*.d,*.l,*.scd和*.tab)前言•数据文件(*.d)在C:MSDchem1data保留时
2、间锁定(RTL)[1],目标化合物扫描[2]和Decon-•谱库文件(*.l)在C:DatabasevolutionReporting[3],所有这些技术在确认某一水平•扫描数据文件(*.scd)在C:Database的化合物时都需要用到保留时间(RT)。对于高效和高质量的分析工作,RT是恒定的/可重现的,并且在质•TAB—限定文件(*.tab)在C:Database谱库中可以查到,这一点很重要[4]。然而,在商业性的质谱库中不是所有的化合物都能查到,而且大多数质谱库没有RTs。这篇技术综述论及了如何(例如,添加某些化合物)建立和编辑RTL扫描数
3、据库、RTL定量数据库和质谱库。用GC/MSD化学工作站软件和MicrosoftExcel就可以完成这些任务,也可以用AgilentDeconvolutionReportingSoftware(DRS)进行RTL定量数据库和质谱库的建立和编辑[3]。建立MS质谱库1.从数据文件(*.d)和.tab文件,建立(扫描)谱库。见表1。*.d文件由谱库条目的峰/质谱图组成。表1..tab文件中各列注释列题目A空(A列在GC为保留时间(RT),在MSD中不填)B名称(化合物名,例如,二甲基……)C化学文摘登记号(CAS号,不用破折号,如,12345,不能用0001
4、2-34-5)D分子式(如,C6H14N2O,不用逗号,破折号,引号等)E分子量(如,32.04)F保留时间(在GC/MSD中,以分钟计,如,12.34)G空(不填)H公司标识号(唯一标识号,如,cmpd01—后面还将加以说明)I文件名(创建谱库所用的.d文件,要用完全文件路径。如C:MSDchem1dataoxymix.d)J目标离子(scd目标离子)K确认离子1(q1)L确认离子1比率(q1rotio)M确认离子1不确定度(q1unc)N确认离子2(q2)O确认离子2比率(q2ratio)P确认离子2不确定度(q2unc)Q确认离子3(q3)
5、R确认离子3比率(q3ratio)S确认离子3不确定度(q3unc)T不确定类型:0=相对,1=绝对(不确定类型)U参考谱库名称(谱库名)*V参考谱库登录号(在谱库中登录号,如15)**创建原始谱库时不用B,C,D,E,F,I列要求填写,其它列留为空白。一个化合物用一行。见如下例子:注意头两行(只是两行)有注释和题目信息。22.首先确认将工作表文件以.tab格式存入数据库文件夹中。打开File
6、Saveas
7、选择Text(Tabdelimited)(*.txt),在引号内键入文件名,.tab为扩展名,如“original.tab”。这将以.tab扩展名存
8、入tab-delimited。3.点击Yes,保存这个格式。4.关闭Excel文件,否则你将从化学工作站中得到一个错误的信息(不能打开文件:C:databaseoriginal.tab)。5.点击No。36.进入EnhancedDataAnalysis。在命令框中键入rtl_import,点击Execute。7.选择Libraryonly,点击OK。(选择“LibraryandSCD”选项,也能同时创建扫描数据库,见以后章节。)8.将提示你从Database文件夹中,选择一个文件。选择你要的.tab文件,点击Open。49.给出谱库名称(最多八个字符
9、),如oxymix.L,点击OK。EnhancedDA将调出你的.tab文件中I列输入的每个文件。然后到F列你选定的RT,用质谱图和B,D,E列的信息创建一个质谱库条目。在你的眼前瞬间展现一个色谱图。如果你在*.tab文件中,填写了H列,谱库建好后,你将得到一个.sav的路径。下面的界面显示了新谱库Oxymix.L,oxymix.tab文件和.sav路径。5什么是.sav路径?当你从一个.tab创建一个谱库时,.sav在Database文件夹中创建的一个文件夹。.sav文件夹包含你刚刚创建的谱库里每一个条目的一个.sav文件。每个.sav文件都包含了谱库
10、条目里的质谱图。.sav文件名从H列得到。如果H列没有填写,你将得不到.sav文
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