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时间:2019-11-26
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1、RNA的抽提与鉴定背景核糖核酸(RiboNucleicAcid,简称RNA)是由至少几十个核糖核背酸通过磷酸二酯键连接而成的一类核酸,因含核糖而得名,简称RNAo遗传信息从DNA传递给RNA,再从RNA传递给蛋白质,即完成遗传信息的转录和翻译的过程。也可以从DNA传递给DNA,即完成DNA的复制过程。这是所有有细胞结构的生物所遵循的法则。在某些病毒中的RNA自我复制(如烟草花叶病毒等)和在某些病毒中能以RNA为模板逆转录成DNA的过程(某些致癌病毒)是対中心法则的补充。三种常见的RNA1-mRNA信使RNA功能:蛋白质合成的直接模板2.tRNA转运RNA功能:氨基酸的运载体3.
2、rRNA核糖体RNA功能:核糖体的组成成分,蛋白质的合成场所其他小分子RNA1.hnRNA核内不均一RNA成熟mRNA的前提2.snRNA核内小RNA参与hnRNA的剪接与转运3.snoRNA核仁小RNArRNA的加工与修饰4.SCRNA/7SL-RNA胞质小RNA蛋白质内置为定位合成信号识别体组成成分5.siRNA小的干扰RNAsiRNA在RNA沉寂通道屮起中心作用,是对特定信使RNA(mRNA)进行降解的指导要素实验原理细胞中的RNA可分为信使RNA,转运RNA和核糖体RNA三类,这三种类型的RNA都存在于细胞质中,所以从不同组织屮提取的总RNA的本质就是细胞的裂解,RNA
3、的释放,通过不同的方式去除蛋白质,DNA等杂质,最终获得高纯度的RNA产品工艺。实验目的1完整RNA的提取和纯化,是进行RNA方面的研究工作,如Nothern杂交、mRNA分离、RT-PCR、定量PCR、CDNA合成及体外翻译等的前提。2临床诊断屮的应用:病毒检测等RNA提取的方法及步骤1提取总核酸,再用氯化锂将RNA沉淀出来。(该方法将导致小分子量RNA的丢失,冃前该方法的使用频率已很低。)2在酸性条件下抽提,酸性下DNA与蛋白质进入有机相而RNA留在水相,而达到分离RNA的目的。根据所用蛋白质变性剂种类不一样分为以下两种制备方法:1弧盐法:异硫氤酸弧和硫氤酸肌2LiCI/尿
4、素法以肌盐法最好,对于从那些RNase含量很高的组织(胰脏)中提取RNA特别有效,可使RNase迅速变性,制备的RNA有较高翻译活性。Trizol(异硫氤酸肌•苯酚法)1由苯酚和硫氤酸肌等配制而成的单相的快速抽提试剂;2可在破碎细胞、降解细胞其它成分的同时保持RNA的完整性;3在氯仿抽提、离心分离后,RNA处于水相中,将水相转管后用异丙醇沉淀RNA;4Trizol可以从最少100个细胞或lmg组织屮提取RNA。如果细胞量过少或组织来源特异,可以采用相应试剂盒提取RNAoTrizol法的原理1异硫氤酸,卜筑基乙醇,SDS裂解细胞2酸性条件(pH4.0)下酚、氯仿抽提,离心,蛋白质
5、,DNA和脂质进入有机相,而RNA存在于水相3界丙醇沉淀水相中的RNATrizol法提取RNA操作步骤1.剪碎的鼠肝中加入Trizol试剂,进行机械匀浆,取lmlTrizol匀浆液于1.5ml离心管内,室温放置5分钟,以充分裂解细胞。目的:变性剂充分作用裂解细胞,释放核酸。2.每管加入200ul氯仿,振荡混匀后室温放置15min;注:禁用漩涡振荡器,以免基因组DNA断裂。3.4°C12,000rpm离心15min;4.吸取上层水相,至另一离心管中;注:不要吸取中间界面。目的:分离RNA、DNA、蛋白质等。5.加入0.5ml异丙醇混匀,室温放置5-10min;6.4°C12,00
6、0g离心lOmin,弃上清,RNA沉于管底;目的:沉淀RNA。异丙醇会夺取大量RNA分子间的水分子,因此RNA分子之间就容易形成氢键而发生沉淀。7.按lml75%乙醇/mlTrizol加入75%乙醇,温和振荡离心管,悬浮沉淀。(此时可放-70°C保存)目的:洗涤RNA,去除残余的盐类等杂质。8.4°ClOOOOrpm离心5min,尽量弃上清。9.短暂离心收集管壁液体并吸弃。室温晾干2-3min0注:RNA样品不要过于干燥,否则很难溶解。10.用200ul(体积可根据RNA的沉淀量具体调整)DEPC处理的H20溶解RNA样品,溶解后立即置于冰上。注:H2O>TE或0・5%SDS均
7、须用DEPC处理并高压。简易TBE电泳观察RNA的完整度1制胶:琼脂糖凝胶粉(0.7%),消毒TBE缓冲液,Goldview显色剂2上样:20ul样品(含上样缓冲液)混匀后,加入凝胶孔中;上样缓冲液(loadingBuffer):漠酚蓝、二甲苯青FF、蔗糖,甘油3电泳:电泳110V,15mino4紫外灯下观察RNA质量及纯度的分析方法一、检测RNA溶液的吸光度260、320、230、280nm的吸光度分別代表核酸、背景(溶液浑浊度)、盐浓度和蛋白质的水平;纯的RNA,230:260:280=
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