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《几种瓜类作物枯萎病病原菌的分子鉴定及其ITS序列差异性分析》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在工程资料-天天文库。
1、几种瓜类作物枯萎病病原菌的分子鉴定及其ITS序列差异性分析郑雪芳蓝江林曹宜肖荣风车建美刘波*(福建省农业科学院生物技术研究所福州350003)摘要:比较和分析了福建省儿种重耍瓜类作物枯萎病病原菌的ITS区序列,结果农明,供试的26个菌株属丁•两种不同类型的镰刀菌:尖他镰刀菌和串珠镰刀菌,其中尖他镰刀菌所占比例较大(54%),为优势种。另外,对尖他镰刀菌和串珠镰刀菌的ITS区序列进行比对分析,结果显示,这两种类型菌株的差界主要表现在1TS2区间,差界达20.4%,而ITS1区间的序列完全相同或只冇1个碱基的差异。对26株供试菌进行亲缘关系分析表明,在同源系数为92%的条件下,2
2、6株镰刀菌被划分为2个类群:第1类为尖泡镰刀菌,第2类为串珠镰刀菌。其中,第2类群中的串珠镰刀菌在同源系数为99%的条件下乂被细分为2个类群。关键词:镰刀菌;分类;鉴定;ITS序列分析IdentificationandclassificationofFusariumwiltfromcucumber,melon,watermelonandbottlegourdinFujianZHENGXue-FangLIUBoLANJiang-LinCAOYiXIAORong-FcngCHEJian-Mci(BiotechnologyInstitute,FujianAcademyofAgric
3、ulturalSciences,Fuzhou350003,China)Abstract:AnexperimentwasconducedtocompareandanalyzesequeceofITS-rDNAliedinFusariumwiltfromsomeimportantcucumisspeciesinFujiang・Resultshowedthat26testestrainswerebelongtotwodifferenttypes:FusariumoxysporumandFusariumtnonilifonne.ThepercentofFusariumoxysporu
4、m,whichwasdominantspecies,was54%inthetotaltestedstniins.ITSsequenceBLASTanalysiswasappliedinFusariumoxysporumandFusariummoniliforme,resultshowedthatmaindiffereceoftwotypeFusariumstrainsliedinITS2,thedifferencofthemwassignificantat20.4%level,however,ITS1sequencesofthemwereabsolutelyidentical
5、oronebasedifferece.Thephylogenetictreeof26testedstrainsindicatedthat26testedstrainswasdividedintotwomajorgroupswhilethehomologyconfficientwas92%.ThefirstgroupwasFusariumoxysporumandthesecondgroupwasFusariummoniliforme,whichwassubdividedintotwogroupswhilethehomologyconfficientwas99%・Keyword:
6、Fusarium;classification;identification;IISsequenceanalysis瓜类作物枯萎病是由致病性镰刀菌引起的,是瓜类作物生产中重大病害Z-O传统对病原真菌的分类、鉴定主要基于形态特征、生理生化指标、致病性测定等,但大部份真菌种类多、分布广、形态特征复杂,不能对未知菌株进行准确鉴定,而且少数形态特征和生理生化指标随着环境的变化而不稳定()。因此,传统的菌株分类鉴定方法引起分类系统的不稳定或意见分歧。随着分子生物技术的发展,RAPD、SSR、AFLP、ITS等分子标记技术被广泛应用于病原真菌的的鉴定(Nicholsonetal.,199
7、3),分类(Alalounakis,1999;Crowhurstrnetal,1995)、分化(Crowhusteta1.,1991)及群体遗传多样性(Pauletal.,2000;Vainioetal.,1998)研究屮。其中克隆和测序真菌核糖体基因,根据其特点进行真菌分类、鉴定和系统发育的研究成为病理学研究新热点(LeeS,1992;CookeDEL,1999:Skouhoe,1999)o棊金项H:国家“八六三”计划项H(2002AA244031-2);福建省自然基金(2006J0068)"通讯作者