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1、棉花学报CottonScience2009,21(5):420～426棉花种质资源遗传多样性的TRAP分析1132222苗培明,范玲,师维军,乌买尔江,徐利民,马君(1.新疆农业科学院核技术生物技术研究所,乌鲁木齐830091;2.新疆农业科学院经济作物研究所,乌鲁木齐830091)摘要:应用TRAP分子标记方法对65份棉花种质资源进行遗传多样性分析。从100对引物中筛选出10对引物,用TRAP2PCR的方法共扩增出252条带,其中210条为多态带,比率为83.33%。利用NTSYSpc2.1遗传学统计分析软件中的UPMGA法对所获得的数据进行聚
2、类分析,建立了65份棉花种质资源的亲缘关系树状图。当遗传相似性系数(GS)为0.84时,65份种质资源可以分为6大类群。所获得的聚类结果与种质资源的地域来源和形态特征有一定的相关性。说明TRAP型的分子标记方法在棉花种质资源鉴定、分类等方面的研究上具有良好的应用前景。关键词:棉花;种质;遗传多样性;TRAP中图分类号:S562.024文献标识码:A文章编号:100227807(2009)0520420207AnalysisofGeneticDiversityinCottonGermplasmbyTRAPMarkers1132222MIAOPei2
3、ming,FANLing,SHIWei2jun,Wumaierjiang,XULi2min,MAJun(1.InstituteofNuclearandBiologicalTechnologies,XinjiangAcademyofAgriculturalSciences,Urumqi830091,China;2.InstituteofEconomicCrops,XinjiangAcademyofAgriculturalSci2ences,Urumqi830091,China)Abstract:Thegeneticdiversityamong65l
4、inesofcottongermplasmwasanalyzedbyTRAP(TargetRegionAmplificationPolymorphism)markers.From100pairofprimers,10pairsofpolymorphicprimerswereselected.Atotalof252bandswereamplifiedfrom10pairsofprimersbyTRAP2PCR,ofwhich210bands(about83.33%)werepolymorphic.The65linesofcottongermplas
5、mwereclus2teredintosixgroupsatGS(geneticsimilarities)=0.8431andthelinkmapwassetupbyUPMGAmethodinNTSYSpc2.1(numericaltaxonomyandmultivariateanalysissystem).Theresultsshowedthatthegermplasmclustershadcertainrelationshipwiththegermplasmoriginsandthemorphologiccharacters.Theresul
6、tssuggestedthatthenewtypeofmolecularmakermethod,TRAP,wassuitableforgeneticidentification,clusterofcottongermplasm.Keywords:cotton;germplasm;geneticdiversity;TRAPTRAP(targetregionamplificationpoly2EST序列信息,使用长度为16～20核苷的固定morphism,目标区域扩增多态性)方法是2003年引物与随机引物,固定引物以公用数据库中目标建立起来的一种新型
7、的基于PCR的分子标记方基因的cDNA或EST序列设计而来;随机引物[1]法,与其它分子标记方法相比较,TRAP方法具是以一段富含AT或GC为核心、可与内含子或有以下特点:(1)操作简单;(2)重复性好;(3)外显子区配对的随机序列。这一方法目前已经在[122][3][4][5]效率高。TRAP方法是基于已知的cDNA或向日葵、小麦、甘蔗、菜豆等农作物得到收稿日期:2008206218作者简介:苗培明(19802),男,硕士研究生;3通讯作者,fanling@xaas.ac.cn基金项目:国家“863”项目(2006AA10Z184),新疆高技术
8、研究发展计划项目(200611101)©5期苗培明等:棉花种质资源遗传多样性的TRAP分析421成功应用。研究结果证明该方法对农作物群体
