基因分析仪的原理与应用

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1、基因分析仪的原理与应用技术支持黄志1内容•仪器系统介绍•测序原理•测序实验流程•测序应用•片段分析原理与应用2仪器系统介绍3仪器的本质电泳仪毛细管电泳仪带荧光检测的毛细管电泳仪带数据收集、储存、分析的自动化毛细管荧光检测电泳仪荧光检测仪毛细管电泳仪数据分析系统检测的对象是带荧光标记的DNA片段4基因分析仪的基本构造计算机分析测序数据CCD相机记录所有通道信号毛细管激光激发所有通道电泳方向高压电源5仪器主要特点•DNA样品自动电进样•通过毛细管电泳分离DNA片段•被荧光标记的DNA片段在毛细管检测窗口被检测•激发出的荧光由于波长不同而被分离，并被

2、CCD相机收集6电进样示意图检测窗口/激光毛细管和电极+电流--------缓冲液样品电进样意味着什么?只有带电分子能够进入毛细管.7毛细管电泳的原理+-正极负极++++++++++HHHHHHHHHH带负电的ＤＮＡ分子向正极泳动，片段的迁移率取决于分子量：小分子量的片段比大分子量的片段泳动得快。8荧光信号检测-•激光束被分割成二维通路Electrophoresis•激光束在检测窗口同时激发并列的毛细管•DNA片段发出的荧光由于波长不同而被区分开•信号被CCD相机收集EnergyLaserdyeCCD+9毛细管检测窗口1011双向激发+=12

3、基因分析仪四大功能•DNA测序—测定DNA片段的碱基排列•片段分析—测定DNA片段的长度和颜色•基因分型—测定多态或点突变•相对定量—比较拷贝数差异13AB公司遗传分析仪24年的发展3730(xl)1986年全球第一台3703733773100(A),3130（xl）,3500（XL）基因分析仪1996年310全球第一台毛细管基因分析仪平板胶电泳毛细管电泳14AB公司遗传分析仪24年的发展1986年370型全世界第一台基因分析仪1991年373型基因分析仪1995年377型基因分析仪，光栅+CCD310型毛细管基因分析仪1997年377

4、-96基因分析仪1998年3700型96道毛细管基因分析仪2000年310016道毛细管基因分析仪2002年3100Avant4道毛细管基因分析仪2002年373048道毛细管基因分析仪3730xl96道毛细管基因分析仪2004年31304道毛细管基因分析仪3130xl16道毛细管基因分析仪2007年新一代超高通量序列分析仪SOLiD2009年3500毛细管基因分析仪全世界约2万台，中国约850台，市场占有率90%15377(36/96)31003500-A35031000xl370031031303130xl37303730xl1

5、68道毛细管基因分析仪350024道毛细管基因分析仪3500xL3500System3500xLSystemUpgrade主要特点:1.新型固体激光,长寿,对实验室要求低.2.使用方便,毛细管与胶更换简单,无线电射频技术实时显示耗材使用状态3.峰高更均一,获取高质量数据4.操作简单,运行速更度快173500/3500XL仪器内部结构8或24道毛细管阵列激光检测窗口胶泵阳极缓冲液槽POP胶袋96&384板&8连管托盘阴极缓冲液槽183500系统硬件特点经过归一化处理，不同仪器、不同运行、不同毛细管间信改善的温控系统，使得片度分析号强度更加一致的精

6、确度进一步提高NoNormalizationWithNormalization3500固体激发光源–直接接入标准电源,降低能耗，新设计的胶泵，减少延长使用寿命19胶的用量，节约成本新颖贴心的耗材设计RFID标签•新型包装设计,预灌装,即拿即用•RFID“无线射频识别技术”标签•耗材实时消耗情况一目了然阴极电泳缓冲液胶袋阳极电泳缓冲液精准的分子量标准安装便捷的毛细管组件灵活多样的样品载盘20灵活的通量选择21简单明了的操作界面软件导航和控制面板显示•按工作流程设计的控制面板，容易掌握•耗材的使用量，批号，失效期等信息一目了然•即时数据查看，标记低

7、质量的数据•自动对测序、片段分析等功能的结果质量进行检查•试剂的启用日期自动记录，无需手写•维修日历，提示何时需要维护及历史记录223500系列的软件整合SecondaryAnalysisMSIDApps:3500DataCollection/PrimaryAnalysisMSID2.xMicrobialIDPharmaQA/QCQSTPublicHealth.ab1ClinicalLabs.BaseCallSeqScape&Var.RawSeqAv5.4ReporterApps:DataSeqScape®v2.7Direct/Medseq.I

8、nstrumentDataCollectionPrimaryAnalysisVariantReporter™v1.1Compseq.w/worefer