基于dna条形码的三种药用植物分子系统学研究

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1、分类号：___________密级:__________UDC:___________基于DNA条形码的三种药用植物分子系统学研究姓名：李奇威学号：2111540068院系：药学院学位类型：医学硕士专业：微生物与生化药学研究方向：微生物资源开发与利用导师：朱爽（副教授）论文提交日期：2018年5月25日论文答辩日期：2018年5月18日学位授予单位：广东药科大学二○一八年五月广东药科大学硕士研究生学位论文PhylogenyanalysisofthreemedicinalplantsbasedonDNAbarco

2、dingCandidate:LiQiweiStudentID:2111540068Affiliation:SchoolofPharmacyAcademicDegreeAppliedfor:MasterofMedicineSpeciality:MicrobiologyandBiochemicalPharmacySupervisor:AssociateProf.ZhuShuangDayofDefence:May2018DegreeConferringInstitution:GuangdongPharmaceutic

3、alUniversity广东药科大学硕士研究生学位论文基于DNA条形码的三种药用植物分子系统学研究摘要三种药用植物沉香、降香、钩藤均具有较多药理活性和较高的药用价值，但存在以假乱真、以次充好及近缘物种难以区分等现象。DNA条形码技术经过10多年的发展与应用，被广泛用于药用植物的物种分类与鉴定，可以弥补传统鉴定方法的不足。本文以这三种药用植物所在属（沉香属、黄檀属、钩藤属）的属内物种为研究对象，基于多条通用条形码（ITS、matK、rbcL、psbA-trnH和trnL-trnF）序列，对DNA条形码技术在药用植

4、物中的可行性进行验证，同时探讨这三种药用植物的属内系统发育关系，为它们的鉴定与分类提供理论依据。得出以下结论：（1）沉香属系统发育分析：使用6个DNA条形码（ITS、matK、rbcL、psbA-trnH、trnL-trnF和ITS+trnL-trnF）对沉香属及拟沉香属23个物种共608条序列进行分析，结果表明组合条形码ITS+trnL-trnF序列具有较多变异位点、较大的种内种间距离和较高的物种鉴别率，且系统发育树中具有较好的分辨能力，但仍较难清晰区分Aquilariacrassna和Aquilariasu

5、bintegra这2个近缘物种。（2）黄檀属系统发育分析：本实验先对3个降香黄檀（Dalbergiaodorifera）样品进行DNA提取、纯化及PCR扩增，进而对GenBank中已有的黄檀属序列进行序列特征分析和系统发育学分析，实验的相关结I广东药科大学硕士研究生学位论文果表明改良CTAB法可用于降香黄檀的DNA提取，组合条形码ITS+matK+rbcL具有比较好的物种鉴定能力，能较好地反映黄檀属物种之间的差异，因此建议使用该组合条形码作为鉴定黄檀属植物的DNA条形码。（3）钩藤属系统发育分析：基于《中国植物

6、志》中记录的12个钩藤物种共132条ITS序列进行分析，结果表明ITS序列比ITS2序列拥有更多变异位点；在系统发育树中，ITS序列阐明了大部分钩藤属物种的亲缘关系；ITS2二级结构可作为区分云南钩藤Uncariayunnanensis和恒春钩藤Uncarialanosa的候选方法。关键词：DNA条形码;沉香属;黄檀属;钩藤属;系统发育学II广东药科大学硕士研究生学位论文PHYLOGENYANALYSISOFTHREEMEDICINALPLANTSBASEDONDNABARCODINGABSTRACTTheth

7、reemedicinalplantsofagarwood,rosewoodandGoutenghadmanypharmacologicalactivitiesandhighmedicinalvalue,buttherewerephenomenasuchasconfusion,shoddyness,andindistinguishablespecies.Aftermorethan10yearsofdevelopmentandapplication,DNAbarcodingtechnologyhasbeenwide

8、lyusedforspeciesclassificationandidentificationofmedicinalplants,whichcanmakeupfordeficienciesintraditionalidentificationmethods.Inpresentstudy,thespeciesbelongingtothegenusAquilaria,Dalbergiaan