水稻ssiia基因与支链淀粉结构及糊化温度的关系研究

水稻ssiia基因与支链淀粉结构及糊化温度的关系研究

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1、浙江大学农业与生物技术学院硕士学位论文水稻SSIIa基因与支链淀粉结构及糊化温度的关系研究姓名:肖鹏申请学位级别:硕士专业:生物物理学指导教师:包劲松20100101摘要糊化温度(gelatinizationtemperature,GT)是衡量稻米蒸煮品质和口感的重要参数之一.本试验研究了支链淀粉链长分布、SSIIa基因序列变异和SSIIa蛋白含量与稻米淀粉糊化温度的关系,旨在从支链淀粉合成过程方面寻找调控糊化温度形成的分子机理。主要研究结果如下:1、选用30份糊化温度变异较大的水稻品系,测定了支链淀粉结构,分析了支链淀粉结构与糊化温度的相关性。结果表明不同稻米支链淀粉的

2、分支链长度不是随机分布的。聚合度(degreeofpolymerization,DP)12-24的链的含量最高,占57%一67%不等,其次是3P6-11的链,含量占18%-28%不等,DP>24的链含量小于15%。糊化温度与DP6—11含量呈显著负相关(r=-0.935,P<0.001),与DPl2-24含量呈显著正相关(r=0.877,P

3、singlenucleofidepolymorphisms,SNP)的酶切扩增多态性序列(cleavedamplifledpolymorphicsequences,CAPS)和衍生型酶切扩增多态性序列(derivedCAPS,dCAPS)标记,随后用这些标记检验了所选材料的SNP基因型。结果表明:4198bp处的A/GSNP和4329/4330bp处的GC/TTSNP与糊化温度密切有关。4198bp处的SNP为G,拥有GCSNP的材料为高、中糊化温度类型,拥有TTSNP的材料为低糊化温度类型。而若4198bp处的SNP为A,则均为低糊化温度。单体型分析也发现了GCSNP和

4、DPl2-24比例、TTSNP和DP6-11支链比例的显著关联。选用两个杂交组合的F:代植株检验了SSIIa基因SNP与糊化温度的共分离情况。在检测的群体中,两组sNP的分离均不符合1:2:1的经典孟德尔分离比,但与糊化温度共分离。3、测定了稻米淀粉粒结合的SSIIa蛋白含量,分析了SSIIa蛋白含量与稻米支链淀粉结构和糊化温度的关系。将对照NIL(A1k)的SSIIa蛋白含量设为1.0,所测样品得ssIIa含量在0.5-1.52.问.SSIIa蛋白含量与糊化温度显著正相关(r=O.855,尺O.001),与SCR显著负相关(r=0.881,P<0.001)。根据这些实验

5、结果,提出了稻米淀粉糊化温度的差异分子机理。关键词:稻米淀粉;糊化温度;支链淀粉结构;SNP;SSIIa蛋白IlAbstractGelatinizationtemperature(GT)isanimportantqualitypredictorthatdeterminesthecookingqualityoffice.Thisresearchfocusedontheside—chainlengthdistributionofamylopectin,SSIIagenevariation、SSIIaproteincontentandtheirrelationshipswith

6、GT,inordertofindthemolecularmechanismregulatingGTfromstarchsynthesisaspect.Themainresultsaleasfollows:1.Atotalof30ricesampleswithlargevariationinGTwereusedtodetermineamylopecinstructure,anditsrelationshipwithGT.Theresultsshowedthattheside-chainlengthwasnotrandomlydistributedamongdifferent

7、riceamylopectin.Thechmnswithdegreeofpolymerization(DP)12—24werethemostabundant,rangingfrom57%一67%,followedbythechainswithDP6·11,rangingfrom18%一28%,andtheamountofchainslongerthanDP24onlyaccountedforabout15%oftotalchains.GTWasnegativelycorrelatedwithDP6—11(r---0.935,P

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