鸡肌肉生长相关基因的表达与肌苷酸关键酶基因网络调控的构建

《鸡肌肉生长相关基因的表达与肌苷酸关键酶基因网络调控的构建》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、鸡肌肉生长相关基因的表达与肌苷酸关键酶基因网络调控的构建AnalysisofGeneExpressionProfilesandConstructionofNetworkforKeyGenesAssociatedwithInosineMonophosphateinChickenMuscles研究生：栾德琴导师：陈国宏教授常国斌副教授国家自然科学基金项目(30972088)、国家科技支撑计划(2011BAD28803)资助SupportedbyNationalNaturalScienceFoundationofChina(No．30972088)andNationalKeyTec

2、hnologyR&DProgram(201BAD28803)鸡肌肉生长相关基因的表达与肌苷酸关键酶基因网络调控的构建煅嬲研究生：栾德琴导师：陈国宏教授常国斌副教授中文摘要本文选取中国地方鸡种如皋黄鸡和外来鸡种隐性白羽鸡种作为研究对象，利用Agilent表达谱芯片技术，分别对不同生长阶段的如皋黄鸡和隐性自羽鸡肌肉组织中相关基因转录特性进行研究，着重分析了2、12周龄两鸡种肌肉组织的差异表达基因，并结合GO分析进行相关差异基因的生物功能分类，探讨不同鸡种肌肉组织中相关基因表达谱的差异及其联系与规律，以期了解不同鸡种肌肉组织的生长发育差异，为进一步探明影响鸡肌肉生长发育的分子机制提

3、供基础。肌苷酸(InosineMonophosphate，IMP)是肉品中重要的风味物质，其在体内的合成代谢过程十分复杂，肌苷酸关键酶基因包括：磷酸焦磷酸酰胺转移酶(PPAT)，磷酸核糖氨基咪唑碳酸酵素(眦CS)，甘氨酰胺核苷酸合成酶(GARS)，5．氨基咪唑核苷酸合成酶(AIRS)，甘氨酰胺核苷酸转甲基酶(GART)，5．氨基咪唑_4．甲酰氨核糖核苷酸甲酰转移酶(ATIC)，腺苷琥珀酸裂解酶(ADSL)，腺苷单磷酸脱氨酶(AMPD)。本文在如皋黄鸡基因芯片数据的基础上，运用Perl语言和皮尔森系数方程求解相关基因间线性关系，结合Cytoscape和GO将影响肌肉组织中肌苷酸

4、关键酶相关基因的网络调控图进行了分析，构建了影响IMP合成途径中关键酶基因网络调控图，以期探明肌肉组织中IMP合成途径中关键酶之间的相互作用机理，主要研究结果如下：1、同一鸡种不同生长阶段差异表达基因的比较(1)利用基因芯片技术，分析了不同生长阶段下(2．12周龄)如皋黄鸡和隐性白羽鸡肌肉组织基因的表达情况，获得了13379个基因的差异表达动态图谱。在如皋黄鸡中，与2周龄相比(P<0．001)，4周龄时有114个基因上调表达，127个基因下调表达；6周龄时有116个基因上调表达，101个基因下调表达；8周龄时有130个基因上调表达，110个基因下调表达；10周龄时有136个基

5、因上调表达，118个基因下调表达；12周龄时有94个基因上调表达，114个基因下调表达。4周龄、12周龄时上调表达基因数量少于下调表达基因的数量，而6周龄、8周龄、10周龄时上调表达基因数量明显多于下调表达基因的数量；在隐性白羽鸡中，与2周龄相比(尸<0．001)，6周龄时有72个基因上调表达，51个基因下调表达；10周龄时有42个基因上调表达，30个基因下调表达；12周龄时有44个基因上调表达，34个基因下调表达。3个生长阶段，上调表达的基因数量均多于下调表达的基因数量。(2)将表达趋势一致的基因归为一类，所有基因可分为12类，相关系数大都集中在O．1之间，如皋黄鸡第6类与

6、第7类相关系数为1，第3类与第7类，第4类与第8类之间相关系数为0；隐性白羽鸡第l类与第2类，第6类与第3、7、11类相关系数均是0，而第6类与第5、10类，第8类与第12类相关系数均是1，可得到：生长发育过程中，隐性白羽鸡表达量发生变化的基因之间的相关系数普遍高于如皋黄鸡。2、不同时期(2周龄、12周龄)生长相关差异基因的表达(1)应用表达谱芯片，对如皋黄鸡和隐性白羽鸡不同时期肌肉组织抽提及纯化的cRNA进行芯片杂交，并对基因表达谱进行分析，如皋黄鸡在不同生长时期(2周龄和12周龄相比)共筛选出差异表达基因208条(P<0．001)，其中已知功能基因108条，表达上调94条

7、，表达下调114条；隐性白羽鸡在不同生长时期(2周龄和12周龄相比)共筛选出差异表达基因78条(尸<0．001)，其中已知功能基因39条，表达上调44条，表达下调34条，经GO分类，两鸡种筛选的基因主要涉及生长发育、分子代谢、免疫应答、生物合成、细胞通信以及蛋白质合成与分解等相关基因，同时经荧光定量PCR技术与蛋白质组技术验证，表达谱芯片结果可靠。在差异基因中包括一些未知的新基因，但具体的功能以及在鸡生长发育、能量代谢等的过程所起到的作用需进一步验证。(2)在差异基因中，如皋黄鸡中共筛选出6条与生长发育