四种斑蝶的线粒体基因组全序列与其在蝶类系统发育分析中的意义

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1、ND4基因外（终止密码子为单独的T），剩余基因的终止密码子都是ATN。四种斑蝶的D-loop区分别长418bp、443bp、404bp和438bp，A+T含量分别为95.0%、93.2%、95.7%和93.4%。它们都含有一些单一的核苷酸重复序列以及微卫星重复序列，如poly(A)，poly(T)，(TA)nand(AT)n。本研究所得的蝶类各科之间的系统发生关系为：（（（（灰蝶科+蚬蝶科）+蛱蝶科）+粉蝶科）+弄蝶科）+凤蝶科。蛱蝶科内部的系统发生关系为：（（（（（（（（蛱蝶亚科+苾蛱蝶亚科）+丝蛱蝶亚科）+闪蛱蝶亚科）+（线

2、蛱蝶亚科+釉蛱蝶亚科））+喙蝶亚科）+眼蝶亚科）+绢蛱蝶亚科）+螯蛱蝶亚科）+斑蝶亚科。上述结果与之前基于多基因或线粒体蛋白编码基因重建的系统发生关系基本一致。谱系年代学分析结果显示，鳞翅目昆虫的分歧时间大约在侏罗纪（139.7Ma；95%置信区间：120.1~160.9Ma）；凤蝶科、粉蝶科、蛱蝶科和灰蝶科的分化时间在中生代的白垩纪，分别为85.7Ma（64.5~107.1Ma）、82.3Ma（64.7~100.8Ma）、78.7Ma（63.2~95.6Ma）和71.9Ma（54.4~90Ma），弄蝶科分化时间大约在新生代古新

3、纪56.6Ma（47.3~66Ma）。关键词：斑蝶亚科；线粒体基因组；系统分析；金斑蝶；绢斑蝶；拟旖斑蝶；青斑蝶；rRNA序列数据；谱系年代学·II·ThecompletemitochondrialgenomesofthefourdanainidspeciesandtheirimplicationsinphylogeneticstudiesofbutterfliesAbstractTheDanainaeisasubfamilyofNymphalidaecontainingmorethan300extantknownspecies

4、allovertheworld,typicallydistributedintropicalareas.Uptothepresent,itstaxonomicstatusamongbutterflylineagesandphylogeneticrelationshipwithotherbutterflygroupsarestillstandingasacontroversialissue,thusmoredetailedhomologousmorphologicalcharactersandmoleculardataarenee

5、dedtoresolvetheseproblems.ThecompletemitochondrialgenomesofthefourexamplarDanainaespecies(Danauschrysippus,Paranticaaglea,Ideopsissimili,andTirumalalimniace)weresequencedusingLong-PCRandprimerwalkingtechnologies,thegeneorganizationandvariabilityofthemitogenomeswerean

6、alyzedcombinedwiththecorrespondingsequencedataofotheravailablebutterflyspecies.Additionally,thephylogeneticanalysesoftheDanainaewithotherbutterflylineageswereconductedbasedontwomitochondrialrRNAsequencedatawiththeBayesianinference(BI)andmaximumlikelihoodmethods(ML),u

7、sing28holometabolousinsectspeciesastheoutgroup,inordertofurtherclarifythehighersystematicsofthemainbutterflygroups;meanwhile,uponthefossilrecords,theoriginanddivergencetimesofthemainbutterflygroupswereestimatedwithrelaxedmolecularclockmethods.Allthegenesinthemitogeno

8、mesoftheDanauschrysippus,Paranticaaglea,Ideopsissimili,andTirumalalimniacewerearrangedinthesameorientationwithoutrearrangementastho