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1、李正国等:传统分离培养结合DGGE法检测榨菜腌制过程的细菌多样性375传统分离培养结合DGGE法检测榨菜腌制过程的细菌多样性李正国1*付晓红1邓伟1杨迎伍1崔英双2赵平2(1.重庆大学生物工程学院基因工程研究中心重庆市高校功能基因与调控新技术重点实验室重庆400044)(2.重庆涪陵榨菜(集团)有限公司重庆408000)摘要:采用传统分离培养和基于16SrRNA作为分子标记的变性梯度凝胶电泳(Denaturinggradientgelelectrophoresis,DGGE)的方法,分析榨菜腌制过程中不同时期的可培养细
2、菌数量、多样性及其群落结构。结果表明,用传统分离与分子鉴定方法获得7个属的细菌类群,其中乳杆菌属(Acidobacterium)是优势菌群,明串珠菌属(Leuconostoc)是次优势菌群。对通过DGGE方法得到的11条16SrRNA优势条带序列进行了比对,结果表明明串珠菌属(Leuconostoc)的丰度最高,是腌制过程中主要的优势菌群,乳球菌(Lactococcuslactis)是次优势菌。传统分离法与DGGE法结合能够更有效的分析榨菜腌制过程中微生物的多样性及其动态变化,获得更全面的微生物多样性信息。关键词:榨菜
3、(Brassicajunceacossvar.tsatsai),16SrRNA,传统分离培养,变性梯度凝胶电泳(DGGE),群落多样性AnalysisofBacterialDiversityDuringtheProcessingofBrassicajunceacossvar.tsatsaibytheCulture-independentandDenaturingGradientGelElectrophoresis(DGGE)MethodsLIZheng-Guo1*FUXiao-Hong1DENGWei1YANGYing
4、-Wu1CUIYing-Shuang2ZHAOPing2(1.GeneticEngineeringResearchCenter,Bio-EngineeringCollege,ChongqingUniversity,KeyLabofFunctionalGeneandNewRegulationTechnologiesunderChongqingMunicipalEducationCommission,Chongqing400044,China)(2.ChongqingFulingZhacaiGroupLtd.,Chongq
5、ing408000,China)Abstract:Bothculture-dependentandculture-independentmethods,denaturinggradientgelelectrophoresis(DGGE)basedonthesequenceof16SrRNAV3regiongene,wereusedtoexaminethetotalbacteriacounts,bacterialdiversityandcommunitystructureofdifferentperiodsBrassic
6、ajunceasalinewatersamples.Theresultsshowedthat7generaofbacteriawereidentifiedfrom19isolatedbacterialpopulationsbythehttp://journals.im.ac.cn/wswxtbcn李正国等:传统分离培养结合DGGE法检测榨菜腌制过程的细菌多样性375traditionalisolationmethod,thedominantbacteriainintestinebelongedtoAcidobacter
7、ium.By16SrRNAV3regiongeneDGGEmethod,11distinctbandswereobtainedfrom16SrDNAamplifications.TheprofileofDGGEfingerprintsofdifferentperiodssalinewaterrevealedthatthemostdominantbacteriagroupwasLeuconostocintheprocessofthefermentation.Thissuggestedthatacombinationofm
8、olecularandtraditionalculturemethodscanbeusedtoanalyzeandmonitorthediversityoftheprocessoffermentationmicrofloraeffectively,andthatwillgiveusmoreinformationofmicroorg
