临床医学8 年制生物信息学课程教学的探讨

《临床医学8 年制生物信息学课程教学的探讨》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在教育资源-天天文库。

1、临床医学8年制生物信息学课程教学的探讨邹凌云，胡福泉（第三军医大学基础医学部，重庆400038）[摘要]结合近年的教学实践，对临床医学8年制本科开设生物信息学课程的必要性以及具体教学过程的实施进行探讨，阐述了在教材选择、教学内容安排和教学方法创新上的一些经验和认识，为该专业生物信息学课程建设和教学实施提供参考。[关键词]8年制；生物信息学；课程教学[中图分类号]G642.3[文献标识码]A近年来，生物信息学在各医学院校越来越受到重视，多所院校相继在临床医学、药学等专业的研究生中开设了生物信息学课

2、程[1]。而对于医学本科层次是否需要开设生物信息学课程这一问题，虽然目前各方面的观点不一，但是已经有一些院校开始进行尝试。临床医学8年制是一种新的临床医学专业人才培养模式，该专业的课程设置与临床医学5年制本科差别较大，课程体系也还处于逐步完善的过程[2]。生物信息学作为一门新课程，在8年制临床医学专业学生培养中的作用正日益受到关注，逐步被一些开设了此专业的院校选择作为必修课或者选修课。此外，临床医学8年制生物信息学课程的教学如何实施，也正在成为一个需要合理解决的现实问题。一、课程开设的必要性生物

3、信息学使用计算机和信息技术来对生物学（包括医学的）数据进行存储、检索、分析和理解，揭示其中的生物学意义，是生命科学的前沿学科[3]。对于医学专业学生而言，通过生物信息学课程学习，能够掌握如何利用互联网上的各种生物信息资源、如何检索和获取生物信息数据、如何选择和使用各种生物信息学软件来分析数据，等等。在实验科学越来越依赖于合理的数据分析的今天，这方面的知识和技能的培养对于医学生今后从事医学科研工作是非常重要的，对于临床实践也有一定的帮助。因此，在医学专业学生中，尤其是将来从事科学研究的研究生中开设

4、生物信息学课程非常必要。我校从2007年开始将生物信息学设置为研究生的基础必修课。在我国医学院校中，临床医学8年制专业学生往往进行单独培养和单独授课，经历的各学习阶段具有连贯性，与其他专业的本科和研究生过程培养基本没有交集[4]，其生物信息学知识和技能的掌握就需要通过专门开设课程来实现。我校从2009年开始开设临床医学8年制生物信息学课程，并设为必修课。概而言之，在临床医学8年制专业中开设生物信息学课程，能够为该专业学生的临床和科研方面的素质的积累提供必要的生物信息学方面的知识，更重要的是使得学

5、生掌握重要的生物信息数据库和分析工具的使用，增强在医学和信息科学交叉的领域解决问题的技能。在这些方面，其意义和在研究生开设这一课程的意义是几乎等同的。二、课程的教学实施（一）教材的选择目前，国内的生物信息学中文出版物有数十种之多，近年来的出版速度还呈上升趋势，新的书籍、电子出版物不断涌现。这些出版物的内容侧重点各不相同，面向的读者群也不一样，并非全部都适合于作为教材[5]。生物信息学是一门发展很快的学科，其中的知识在不断更新中，相关出版物的内容更新也比较快，这也给教材的选择增加了难度。医学院校生

6、物信息学教学不要求学生掌握该学科中复杂的理论和大量的算法原理，而注重对学生实践能力的培养，因此应该选择能够深入浅出讲授理论知识，并且注重应用，能够理论联系实际的出版物作为教材。我们通过内容比较，选择了一些适合于作为医学院校生物信息学课程教材的书籍，列于表1。表1一些适合医学院校作为教材使用的生物信息学出版物书名作者（编者）出版社出版时间适合教学对象生物信息学赵国屏等科学出版社2008本科、研究生生物信息学许忠能等清华大学出版社2008本科生、研究生生物信息学陶士珩等科学出版社2007本科生、研究

7、生生物信息学李霞等人民卫生出版社2010本科生、研究生生物信息学基础孙啸等清华大学出版社2005研究生生物信息学分析实践吴祖建等科学出版社2010实践课使用生物信息学实验指导于浩等吉林大学出版社2009实践课使用生物软件选择与使用指南李军等化学工业出版社2008实践课使用我们选择人民卫生出版社出版的《生物信息学》（李霞主编）一书作为临床医学8年制生物信息学课程教材，该书是卫生部“十一五”规划教材，专门针对8年制及7年制临床医学等专业学生编写。国内多所医学院校生物信息学教学骨干教师参与了该书的编写

8、工作。该书的内容翔实，图文并茂（彩色插图），注重以问题为中心来展开理论阐述和应用分析，注重实例分析和知识拓展，带有课后习题，既能满足课堂教学的需要，也适合于学生课后阅读和自学。此外，该书还特别增加了多个章节来介绍计算表观遗传学、人类复杂疾病与计算系统生物学、单核苷酸多态性与人类疾病、microRNA与复杂疾病等方面的知识、资源、方法和工具，及时地收纳了临床医学涉及的生物信息学研究方面的内容，满足了教师和学生的双重需求，既是一本合适的教材，也是一本合适的参考书。我们针对8年制学生的特点对该书的内容