中国甘肃青海5个民族群体str基因座遗传多态性及其应用研究

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1、中国甘肃青海5个民族群体STR基因座遗传多态性及其应用研究中南大学'学版)2006JCentSouthUnivMedSci,31(6)()……877中国甘肃青海5个民族群体STR基因座遗传多态性及其应用研究陈腾,金天博,辛娜,赖江华,李生斌'(西安交通大学1.医学院法医系;2.环境与疾病相关基因教育部重点实验室,西安710061)【摘要】目的:研究中国甘肃青海地区5个少数民族群体(土族,撒拉族,东乡族,保安族,裕固族)STR基因座的遗传多态性及其应用.方法:选择9个STR基因座(D3S1358,VWA,FGA,THO1,TPOX,C

2、SF1PO,D5S818,D13S3J7,D7S820),采用sTR复合扩增及荧光标记STR基因扫描技术,用ABI377全自动测序仪进行基因分型,同时检测5个少数民族群体的606个健康无关个体血液样本.计算5个少数民族群体的多态信息量,杂合度,个体识别力以及非父排除率等遗传多态性指标.结果:9个STR位点的基因型在5个少数民族群体中的分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律.5个少数民族群体9个STR位点的多态信息量范围在0.6054～O.8735之间;杂合度在0.6l58～0.8736之间;个体识别力在0.7964～0.96

3、9l之间;非父排除率在0.46l0～0.8838之间.采用基于基因频率的聚类分析发现,甘肃青海地区的土族,撒拉族,保安族及东乡族在起源上较为接近,而裕固族则相对较远;5个民族群体与中国南北方民族各群体之间有明显的基因交流现象.结论:在5个少数民族群体中,9个STR位点均为高度多态性遗传性标记,可用于群体遗传学,法医学等领域的研究,具有较高的应用价值.【关键词】群体遗传学;短串联重复序列;遗传多态性;聚类分析[中图分类号]R587,l[文献标识码]A[文章编号]l672-7347(2006)06-0877-06Geneticpolym

4、orphismsandapplicationof9STRlociof5ethnicgroupsinGansuandQinghaiCHENTeng',JINTian—bo.,XINNa.,LAIJiang—hua.,LISheng—bin.''(1.DepartmentofForensicScience,MedicalS002of'allJiaotongUniversity:2.KeyLaboratoryofEnvironmentandGenesRelatedDiseases,MinistryofEducation,'an710061

5、,China)Abstract:ObjectiveToexaminethegeneticpolymorphismof9STRlociin5ethnicgroups(includingTu,Sala,Dongxiang,BaoanandYugu)inGansuandQinghai,andtoevaluateitsappli—cation.MethodsNineSTRloci(D3S1358,FGA,TH01,D7S820,VWA,CSF1PO,D5$818.D13S317andTPOX)wereselectedasgeneticmar

6、ker~.WithSTRcompoundamplificationandge—nescanmethods,inwhichSTRlociweremarkedbyfluorescence,thegenotypeof5ethnicgroupswereexaminedin606unrelatedindividualsbyABI377sequencer.Theseparameters,suchaspoly—morphisminformationcontent(PIC),heterozygosity(H),discriminationpower

7、(DP)andprobabilityofpaternityexclusion(PPE)werecalculated.ResultsThegenotypefrequenciesofthe9STRlociwereinaccordancewithHardy—Weinbergequilibrium.PICwaswithin0.6054—0.8735,Hwaswithin0.6158—0.8736,DPwaswithin0.7964—0.9691,andPPEwaswithin0.4610—0.8838.Clusteranalysisbase

8、donallelefrequenciesingenesisshowedTu,Sala,DongxiangandBaoanethnicgroupswereveryclose,butYuguwasalittlebitfar.Therewe