大豆株高QTL的“整合”及Overview分析-论文.pdf

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1、选HEREDITAS(Beijing)2013年2月，35(2)：215—224ISSN0253—9772WWW．chinagene．CI3研究报告DoI：l0．3724／SP．J．1005．2013．00215大豆株高QTL的“整合”及Overview分析高利芳，一，郭勇，郝再彬，邱丽娟1．桂林理工大学，桂林541000；2．中国农业科学院作物科学研究所，国家农作物基因资源与遗传改良重大科学工程，北京100081摘要：株高是作物株型的重要组成因子，与作物种植密度、抗倒伏性及产量等密切相关。文章利用Soybase数据库和文献报道的201个与大豆株高相关的Q

2、TL信息，在物理整合的基础上，采用软件BioMercator2．1进行元分析，得到15个株高的“通用”QTL，分别位于大豆的6号、7号、11号、13号和l8号染色体。同时，利用基于统计学原理的Overview方法进行优化，将这些QTL位点的置信区间最小缩至0．1cM，从而明确了QTL位点在染色体上的遗传位置。对重演性较好的QTL位点所对应的区段内的基因进行分析，初步筛选出可能与株高相关的候选基因17个。文章为大豆株高相关QTL位点的精细定位及分子标记辅助育种奠定了基础。关键词：大豆；株高；元分析；Overview分析Integrationand‘‘Over

3、view’’analysisofQTLsrelatedtoplantheightinsoybeanGAOLi—Fang，GUOYong，HAOZai．Bin，QIULi．Juan1．GuilinUniversityofTechnology，Guilin541000，China；2．TheNationalKeyFacilityforCropGeneResourcesandGeneticImprovement(NFCR1)／lnstituteofCropScience，ChineseAcademyofAgriculturalSciences，Beijing10

4、0081，ChinaAbstract：Plantheight，oneofthemostimportantfactorsforplantarchitectures，iscloselyrelatedwithsomeimportanttraitssuchasplantdensity，lodgingresistanceandyields．．Inthepresentstudy,201QTLsrelatedtoplantheightofsoybeanfromdatabaseandreferenceswereanalyzed．Theresultsrevealedthat

5、15consensusQTLslocatedonchromosomes6，7，l1，13，andl8wereidentifiedafterphysicalintegrationsandMetaanalysisusingthesoftwareBioMercator2．1．Moreover，“Overview”methodwasusedtooptimizetheseQTLsbasedonstatisticanalysis．SomeofthevalidQTLregionswerenat-roweddowntothe0．1cMandmappedoncertainc

6、hromosomes．Furthermore，thefunctionsofallgeneslocatedintheseconfidenceregionswerepredictedand17candidategenesthatmightberelatedtoplantheightwereidentified．TheseresultswouldlayafoundationforfinemappingofQTLsrelatedtoplantheightandmarker-assistedbreedinginsoybean．Keywords：soybean；pla

7、ntheight；Metaanalysis；Overviewanalysis收稿日期：2012-08—16；修回日期：2012—09—13基金项目：国家自然科学基金项目f编号：31271753)资助作者简介：高利芳，硕士研究生，专业方向：化学与生物工程。E．mail：cwhgaolifang．@163．com通讯作者：邱丽娟，研究员，研究方向：大豆基因发掘与利用。E．mail：qiulijuan@263．net网络出版时间：2012—10．1014：48：40URL：http：／／www．cnki．net／kcms／detail／11．1913．R．201

8、21O10．1448．004．html216逢HEREDITAS(